[发明专利]检测与酿造有关的微生物的方法和可用于此方法的核酸分子有效
申请号: | 00813331.X | 申请日: | 2000-09-08 |
公开(公告)号: | CN1376206A | 公开(公告)日: | 2002-10-23 |
发明(设计)人: | 马库斯·范德克;亚力克山大·加什;克纳利亚·柏克豪夫 | 申请(专利权)人: | 生物技术检测股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 长沙正奇专利事务所有限责任公司 | 代理人: | 卢宏 |
地址: | 德国柏林市*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 酿造 有关 微生物 方法 可用 于此 核酸 分子 | ||
1.检测样品中与酿造有关的微生物的方法。该方法包括下列步骤:
(a)将样品与至少包括两个一级核酸分子(引物)的组合接触。
此核酸分子与和酿造有关的微生物核酸的一个保守区域杂交;
(b)扩增微生物核酸分子或其一部分,以产生至少一个扩增片段;
(c)将在步骤(b)中获得的扩增片段与至少一个二级的核酸分子(探针)接触,上述二级核酸分子与至少一个扩增片段进行杂交,这个扩增片段包括一个对于所有与酿造有关的微生物的,或对于一个或多个与酿造有关的微生物的科、属、种的微生物核苷酸的特异的片段;
(d)鉴别至少一个由扩增片段和从c)中得出的二级核酸分子共同构成的杂交核酸分子。
2.根据上述权利要求之一所述的检测方法,其特征在于是包括PCR扩增步骤的方法。
3.根据上述权利要求之一所述的检测方法,其特征在于是又包括连接酶链反应的方法。
4.根据上述权利要求之一所述的检测方法,其特征在于是又包括等温核酸扩增反应的方法。
5.根据上述权利要求1到4之一所述的检测方法,其特征在于是又对二级核酸分子进行修饰和标记的方法;此修饰和标记可选用以下物质完成:(i)放射性物质,(ii)染料,(iii)荧光物质(iv)能够固定在固定项上的物质和(v)可以与核苷酸分子直接或间接地,特别是借助抗体,抗原,酶和/或与酶亲和的物质或酶合物进行反应的物质。
6.根据上述权利要求之一所述的检测方法,其特征在于其中一级和/或二级核酸分子的长度至少为10个,最好为15-30碱基。
7.根据上述权利要求之一所述的检测方法,其特征在于是对其中的一级和/或二级核酸分子进行过修饰的方法;此修饰是将10个相连的核苷酸中的至多20%,特别是10er片段中的1或2个核苷酸,通过细菌中非天然存在的核苷酸替代。
8.根据上述权利要求之一所述的检测方法,其特征在于保守区域存在于含有细菌的23S和5S基因的基因片段的方法。
9.作为探针和/或引物检测与酿造有关的微生物的核酸分子,其选取范围如下:
(i)包含SEQ ID NO 1-107的一个序列,或此序列中一长度为10个,最好是15到30个碱基的片段的核酸分子;
(ii)与一个(i)中核酸分子发生特异性杂交的核酸分子;
(iii)与一个(i)或(ii)中的核酸分子具有70%,最好至少90%的相同性的核酸分子;
(iv)与一个(i)到(iii)中的核酸分子互补的核酸分子。
10.根据权利要求9所述的核酸分子,其特征在于是DNA或RNA的核酸分子。
11.根据权利要求9所述的核酸分子,其特征在于是PNA的核酸分子。
12.根据权利要求9至11所述的核酸分子,其特征在于其中10个相连的核苷酸中的至多20%,特别是10er片段中的1或2个核苷酸,被细菌中非天然存在的核苷酸替代。
13.至少包括两个核酸分子的组合,该组合从以下选出:
(1)由至少两个权利要求9到12中所述的核酸分子组成的组合;
(2)由至少一个带有SEQ ID-No.40到47序列之一的核酸分子,与另一个至少带有SEQ ID-No.48-54中或SEQID-No.55-59或SEQ ID-No.60-72序列之一的核酸分子的组合。
14.含有一个权利要求9到12中所述核苷酸分子和/或一个 13中的核酸分子组合的试剂盒。
15.根据权利要求1到8中所述的方法,其特征在于此方法中的步骤(a)中使用了至少两个按照权利要求13得出的核酸分子的组合。
16.根据权利要求1到8及权利要求15中所述的方法,其特征在于此方法中使用至少一个由权利要求9到12中得出的核酸分子作为二级核酸分子(探针)。
17.根据权利要求16中所述的方法,其特征在于此方法中使用至少一个带有SEQ ID No.35-39或98-107序列之一的核酸分子作为二级核酸分子(探针)。
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