[发明专利]使用样品拆分和DNA标签进行稀有细胞分析

权利要求书

1.一种用于确定胎儿染色体拷贝数的基于计算机的系统，其是基于来自妊娠或怀疑有妊娠的人女性的血液中的胎儿和母体细胞或DNA的混合样品来确定胎儿染色体拷贝数，所述系统包括:

处理器，用于执行计算机可执行逻辑；

存储器，用于存储计算机可执行逻辑和数据；

富集装置，用于富集所述混合的母体血液样品中的胎儿细胞或胎儿DNA，所述混合的母体血液样品获得自正在妊娠或怀疑有妊娠的人女性，并且所述富集增加了样品中胎儿细胞或胎儿DNA的浓度或者胎儿细胞或胎儿DNA对母体细胞或母体DNA的比率；

拆分装置，用于将富集产物拆分到载体上至少100个离散位置从而将各个细胞定位在可用作所述载体上可寻址部位的离散的位点，使得每个离散可寻址位置包含0或1个胎儿细胞，其中每个离散可寻址位置被分配对每个离散部位特异性的独有标签序列；

标记装置，用于通过扩增用独有标签序列标记在每一离散位置的一个或多个基因组DNA区，所述标记装置包括PCR引物，所述PCR引物包含对每个离散部位特异性的独有标签序列；

用于纯化和合并所述标记的基因组DNA区的装置；

分析装置，用于通过超深测序分析合并的基因组DNA区从而定量所述基因组DNA区，基于扩增的基因组DNA区的独有标签序列，通过鉴定非母体等位基因确定所述载体上离散可寻址位置哪些含有胎儿细胞或胎儿DNA；和

基于所述带有独有标签序列标记的胎儿细胞或胎儿DNA的基因组DNA区的数量确定胎儿染色体拷贝数的装置。

2.权利要求1的系统，其中所述基因组DNA的区域包含一种或多种多态性。

3.权利要求2的系统，其中所述多态性为短串联重复序列(STR)或单核苷酸多态性(SNP)。

4.权利要求l的系统，其中所述标记包含长度介于4-20bp之间的核酸序列。

5.权利要求1的系统，其中标记目标染色体上的至少两个基因组DNA区。

6.权利要求l的系统，其中所述基因组DNA区位于两个或更多个目标染色体上。

7.权利要求l的系统，其中所述分析还包括进行定量基因分型。

8.权利要求l的系统，其中所述胎儿染色体拷贝数表示选自以下的异倍性：13三体性、18三体性、21三体性(唐氏综合征)、克兰费尔特综合征(XXY)、单体性、三倍性、四倍性或其它不规则数量的性染色体或常染色体，及其组合。

9.权利要求7的系统，其中所述定量基因分型使用分子倒置探针技术进行。

10.权利要求1的系统，其中所述分析装置实施选自以下的分析方法进行:FISH、胎儿生物标记标记、SNP检测、PCR和STR检测。

11.权利要求8所述的系统，其中所述胎儿异倍性包括单体性。

12.权利要求11所述的系统，其中所述单体性包括X染色体单体性。

13.权利要求1所述的系统，其中所述分析还包括合成测序。

14.权利要求1所述的系统，其中拆分装置用于将富集产物拆分到至少500个离散位置从而将各个细胞定位在离散的位点。