[发明专利]A型流感病毒流行毒株检测和分型基因芯片及使用方法无效

专利信息
申请号: 200810194822.2 申请日: 2008-11-10
公开(公告)号: CN101487061A 公开(公告)日: 2009-07-22
发明(设计)人: 刘奋勇;李稀罕 申请(专利权)人: 泰州亲和力生物技术有限公司
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;G01N21/00
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 225300江苏省泰州市*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 流感病毒 流行 检测 基因芯片 使用方法
【权利要求书】:

1.一种用于对A型流感病毒流行毒株检测和分型的基因芯片,其特征是它 包括对H1N1、H3N2、H5N1、H9N2四种亚型进行检测和分型的79条特异性寡核 苷酸探针、两条质控探针和载体,两条质控探针为质控探针I和质控探针II, 其中特异性寡核苷酸探针和质控探针I分布在载体上,

对H1N1进行检测和分型的特异性寡核苷酸探针的序列

编号 名称 序列 1 H1N1-HA-1 ATGCCAACAACTCAACCGAC 2 H1N1-HA-2 ACTTGAGAAGAATGTGACAGTGAC 3 H1N1-HA-3 ACACAGAATGCCATTGACGG 4 H1N1-HA-4 GAAATTGGAAATGGCTGCTTTGA 5 H1N1-HA-5 CTATATGAGAAAGTAAGAAGCCAGC 6 H1N1-NA-1 CTAGTGGGAGCAGCATTTCTTT 7 H1N1-NA-2 TTGTGGCGTTGATAGTGATACTG 8 H1N1-NA-3 ATTCATCTCTTTGTTCTATCAGTGGA 9 H1N1-NA-4 ATACACAAAAGACAACAGCATAAGAAT 10 H1N1-NA-5 CTAATGGATGGACAGATACCGATAG 11 H1N1-NA-6 GATTGGTCAGGATACAGTGGAAG

对H3N2进行检测和分型的特异性寡核苷酸探针的序列

12 H3N2-HA-1 CTGTTACCCTTATGATGTGCCG 13 H3N2-HA-2 GAACGCAGCAAAGCCTACAG 14 H3N2-HA-3 ATTAACAGCACAGGGAATCTAATTG 15 H3N2-HA-4 CAATAATGAGATCAGATGCACCCA

16 H3N2-HA-5 GAACAAAGAAGCAACTGAGGGA 17 H3N2-HA-6 GCTGAGGATATGGGCAATGG 18 H3N2-HA-7 ATGACAACAGCACGGCAAC 19 H3N2-HA-8 CAACAGGTAGAATATGCGACAGT 20 H3N2-HA-9 CTGTTACCCTTATGATGTGCCG 21 H3N2-HA-10 TTATGCCTCCCTTAGGTCACTAG 22 H3N2-HA-11 GGATGCGGAATGTACCAGAGA 23 H3N2-HA-12 AACTAGAGGCATATTCGGCG 24 H3N2-HA-13 GGGTCAATCAGAAATGGAACTTATG 25 H3N2-NA-1 TGACCAACACCACCATAGAGAA 26 H3N2-NA-2 AGCAGAATACAGAAATTGGTCAAAG 27 H3N2-NA-3 ATGCGATCCTGACAAGTGTTATC 28 H3N2-NA-4 GGACAGGGAACAACACTAAACAA 29 H3N2-NA-5 ATGGAGTGAAAGGCTGGGC 30 H3N2-NA-6 TCCTGGTAACTACTGTAACATTGC 31 H3N2-NA-7 GCCACAATATGCTTCCTTATGC 32 H3N2-NA-8 GTATCTGACCAACACCACCATAG 33 H3N2-NA-9 CTGTGTGAACCAACAATAATAGAAA 34 H3N2-NA-10 GCTCAAGTTGTCACGATGGAA 35 H3N2-NA-11 CCTATTGATGAATGAGTTGGGTGT

36 H3N2-NA-12 GAGGCTTGTAGATAGTATTGGTTCA 37 H3N2-NA-13 CATAGTTGACAGAGGTAATAGGTCC

对H5N1进行检测和分型的特异性寡核苷酸探针的序列

38 H5N1-HA-1 CGACAGAGCAGGTTGACACA 39 H5N1-HA-2 TCAAGAAAGGGGACTCAGCAA 40 H5N1-HA-3 AAGGCAATAGATGGAGTCACC 41 H5N1-HA-4 GCCGTTGGAAGGGAATTTAATAAC 42 H5N1-HA-5 AACAAGAAGATGGAAGACGGATT 43 H5N1-HA-6 CGGAATGGTCTTACATAGTGGAG 44 H5N1-HA-7 CCAGCCAATGACCTCTGTTAC 45 H5N1-HA-8 GCTACAATAATACCAACCAAGAAGA 46 H5N1-HA-9 CCTAATGATGCGGCAGAGC 47 H5N1-HA-10 TGCCATTCCACAACATACACC 48 H5N1-HA-11 AAGTGAATTGGAATATGGTAACTGC 49 H5N1-HA-12 CCGCAGTATTCAGAAGAAGCAA 50 H5N1-HA-13 TTATTCAACAGTGGCGAGTTCC 51 H5N1-HA-14 AAGAACTGAAACACCTATTGAGCA 52 H5N1-NA-1 TGGAGGAACAACATACTGAGAAC 53 H5N1-NA-2 GGCATAATAACAGACACTATCAAGA 54 H5N1-NA-3 AGCACTAATTCCAGGAGCGG

55 H5N1-NA-4 CCAGAACTGACAGGATTAGATTGC 56 H5N1-NA-5 ATTGGTCAGGATATAGCGGGAG 57 H5N1-NA-6 GCCGTTCATCTCATGCTCC 58 H5N1-NA-7 TTGACTCAGGGAGCCTTGC 59 H5N1-NA-8 TGGAGGAACAACATACTGAGAAC 60 H5N1-NA-9 TTACTGTAATGACTGATGGACCAAG 61 H5N1-NA-10 TTCGGAGACAATCCACGCC 62 H5N1-NA-11 TGGCATGGCTCAAATCGGC 63 H5N1-NA-12 AGCACTAATTCCAGGAGCGG 64 H5N1-NA-13 GGTGGACTGGAACGGACAG

对H9N2进行检测和分型的特异性寡核苷酸探针的序列

65 H9N2-HA-1 GCATCGGCTACCAATCAACAA 66 H9N2-HA-2 TGTTCCTGTGACACATGCCA 67 H9N2-HA-3 ATGCCAAAGAATTACTCCACACA 68 H9N2-HA-4 AGAATTGCTAGTGCTGCTTGAA 69 H9N2-HA-5 CAGGTCAGACATTGCGAGTG 70 H9N2-HA-6 ATGGTATGGACACATTCTTTCAGG 71 H9N2-HA-7 ACAAGGACTGACACAACAAC AA 72 H9N2-HA-8 AGGTCAGACATTGCGAGTAAGA 73 H9N2-HA-9 TCTATGGCAATCCTTCCTGTGA

74 H9N2-HA-10 TCGGATTCATTCTACAGGAGCA 75 H9N2-HA-11 AATACCACATTGCCATTCCACA 76 H9N2-NA-1 GGTATTCTGGTATCTTCTCTGTTGA 77 H9N2-NA-2 CCACGGCTAATTCCAAGTCAC 78 H9N2-NA-3 AAGTGGCAGAATACAAGAATTGGT 79 H9N2-NA-4 GTCAAATTACAGGGTTCGCTCC

两条质控探针的序列

80  I  CGTATATAAAACGGAACGTCGAAGG

81  II  CCTTCGACGTTCCGTTTTATATACG-cy3

            。

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