[发明专利]手足口病LAMP检测试剂盒及其检测方法无效
申请号: | 201010170608.0 | 申请日: | 2010-05-10 |
公开(公告)号: | CN102242223A | 公开(公告)日: | 2011-11-16 |
发明(设计)人: | 刘代新;刘军辉;李昂 | 申请(专利权)人: | 上海吉美生物工程有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
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地址: | 200092 上海市杨*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 手足 lamp 检测 试剂盒 及其 方法 | ||
技术领域
本发明属于生物技术领域,涉及一种用环介导等温扩增(LAMP)技术快速检测手足口病病原体的试剂盒,并涉及一种使用该种试剂盒快速检测手足口病病原体的方法。
背景技术
手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)是由肠道病毒引起的全球性传染病,世界大部分地区均有流行报导,多发生于婴幼儿,可引起手、足、口腔等部位的疱疹,在少数患者中可引发心肌炎、肺水肿、脑膜脑炎等并发症。引起该病的主要病原体为柯萨奇病毒A组16型(Coxsackie A16,CAV16)和肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)。传统的手足口病病原体检测方法包括病毒分离与中和试验鉴定两步,大概要一周以上的时间,而且步骤繁琐,费时费力。环介导的等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)通过识别靶序列上6个特异区域的引物,在一种具有链置换特性的DNA聚合酶作用下,能够在恒温条件下特异、高效、快速地扩增DNA靶序列,在反应体系中加入逆转录酶,可以检测RNA靶序列。LAMP在合成DNA的同时还产生大量的焦磷酸根离子,它们能与镁离子结合生成白色的焦磷酸镁沉淀,可根据反应体系中是否形成白色沉淀来定性判断。
发明内容
本发明的目的在于利用LAMP技术,研制出适用于临床检测手足口病病原体柯萨奇病毒A16型和肠道病毒EV 71型的试剂盒及检测方法。
本发明的技术方案:
一种手足口病病原体检测试剂盒,包括以下成分:
(1)病毒RNA提取试剂
病毒RNA的抽提可以采用常规的Trizol法,也可使用各生物公司生产的病毒RNA抽提试剂盒。
(2)LAMP检测反应液
①反应液Cox A16-用于检测柯萨奇病毒A16型
含有以下成分:
10 x LAMP缓冲液(200mmol/L Tris-HCl,100mmol/L KCl,20mmol/LMgSO4,100mmol/L(NH4)SO4,1.0%Tritonx-100);100mmol/L MgSO4;25mmol/L dNTP;5mol/L betaine(甜菜碱);20umol/L引物CoxA16-FIP;20umol/L引物CoxA16-BIP;5umol/L引物CoxA16-F3;5umol/L引物CoxA16-B3;DEPC处理水。
其中引物序列为:
CoxA16-FIP:
5-AAGTRGGTTTCGGAGCCCCTTTTTTAGCCAAACCCAATGGTGAG-3
CoxA16-BIP:
5-TTYGCTTGGCARACTGCTACCATTTTAGGGGACTGACACTTGAGC-3
CoxA16-F3:5-ACATGCGCTTTGAYGCTGAA-3
CoxA16-B3:5-GCACTGGCTGGTGACATG-3
②反应液EV71-用于检测肠道病毒71型
10 x LAMP缓冲液(200mmol/L Tris-HCl,100mmol/L KCl,20mmol/LMgSO4,100mmol/L(NH4)SO4,1.0%Tritonx-100);100mmol/L MgSO4;25mmol/L dNTP;5mol/L betaine(甜菜碱);20umol/L引物EV71-FIP;20umol/L引物EV71-BIP;5umol/L引物EV71-F3;5umol/L引物EV71-B3;DEPC处理水。
其中引物序列为:
EV71-FIP:
5-CAACTTCCCCGGTGGGTGTGTTTTCCTACATGCGCTTTGATGCA-3
FV71-BIP:
5-TATGTTTGTGCCACCTGGAGCCTTTTGGGGTTAGTGGCGGTTTG-3
EV71-F3:5-GCGCAAATGCGTAGAAAGG-3
EV71-B3:5-AGGGTCTGACAGCTTGACAA-3
③酶混合液
包括Bst DNA聚合酶(8U/ul)和AMV逆转录酶(8U/ul)
本发明的另一技术方案是:
一种手足口病病原体LAMP检测试剂盒检测柯萨奇病毒A16型和肠道病毒71型的检测方法,其主要技术步骤包括:
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