[发明专利]一种FGFR2基因多态性检测特异性引物和液相芯片有效

专利信息
申请号: 201110110737.5 申请日: 2011-04-29
公开(公告)号: CN102304568A 公开(公告)日: 2012-01-04
发明(设计)人: 许嘉森;郭婧;罗彩英;孙贤标 申请(专利权)人: 广州益善生物技术有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 代理人: 万志香;曾旻辉
地址: 510663 广东省广州市广州科*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 fgfr2 基因 多态性 检测 特异性 引物 芯片
【权利要求书】:

1.一种FGFR2基因多态性检测液相芯片,其特征是,主要包括有:

A.针对FGFR2基因的不同多态性位点分别设计的野生型和突变型特异性ASPE引物,每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端的针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成,所述特异性引物序列分别选自:针对C130T的SEQ ID NO.17和SEQ ID NO.18、针对T167C的SEQ ID NO.19和SEQ ID NO.20、针对T189C的SEQ ID NO.21和SEQ ID NO.22、针对T115C的SEQ ID NO.23和SEQ ID NO.24、针对G107A的SEQ ID NO.25和SEQ ID NO.26、针对C76T的SEQ ID NO.27和SEQ ID NO.28、针对C101T的SEQ ID NO.29和SEQ ID NO.30、针对G81A的SEQ ID NO.31和SEQ ID NO.32中的一对以上;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ IDNO.16中的序列;

B.分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码微球,所述anti-tag序列选自SEQID NO.33~SEQ ID NO.48中的序列,且所述anti-tag序列能相应地与A中所选tag序列互补配对,所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列;

C.用于扩增相应的具有C130T、T167C、T189C、T115C、G107A、C76T、C101T、G81A中的一个以上多态性位点的目标序列的引物。

2.根据权利要求1所述的FGFR2基因多态性检测液相芯片,其特征是,所述扩增引物选自:针对C130T的SEQ ID NO.49和SEQ ID NO.50、针对T167C的SEQ ID NO.51和SEQ ID NO.52、针对T189C和T115C的SEQ ID NO.53和SEQ ID NO.54、针对G107A的SEQ ID NO.55和SEQID NO.56、针对C76T的SEQID NO.57和SEQ ID NO.58、针对C101T的SEQ ID NO.59和SEQ ID NO.60、针对G81A的SEQ ID NO.61和SEQ ID NO.62中的一对以上。

3.根据权利要求1所述的FGFR2基因多态性检测液相芯片,其特征是,所述特异性ASPE引物分别选自:针对C130T的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.17组成的序列及由SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.18组成的序列、针对T167C的由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.19组成的序列及由SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.20组成的序列、针对T189C的由SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.21组成的序列及由SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.22组成的序列、针对T115C的由SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.23组成的序列及由SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.24组成的序列、针对G107A的由SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.25组成的序列及由SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.26组成的序列、针对C76T的由SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.27组成的序列及由SEQ ID NO.12和SEQ ID NO.28组成的序列、针对C101T的由SEQ ID NO.13和SEQ ID NO.29组成的序列及由SEQ ID NO.14和SEQ ID NO.30组成的序列、针对G81A的由SEQ ID NO.15和SEQ ID NO.31组成的序列及由SEQ ID NO.16和SEQ ID NO.32组成的序列中的一组以上。

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