[发明专利]用于治疗和诊断结直肠癌的方法和组合物

权利要求书

1.一种检测样品中的结直肠癌的方法，包括：a)将所述样品与检测由选自SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D_1024、MMP7、MMP12、NMU、WNT10A的基因编码的标记物中的至少一种的表达的一种或多种试剂接触；b)将非癌性细胞与得自a)的所述一种或多种试剂接触；以及c)将所述样品中由选自SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D_1024、MMP7、MMP12、NMU、WNT10A的基因编码的标记物中的一种或多种的表达水平与所述非癌性细胞中选自SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D_1024、MMP7、MMP12、NMU、WNT10A的标记物中的一种或多种的表达水平进行比较，其中与所述非癌性细胞相比在所述样品中由选自SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D_1024、MMP7、MMP12、NMU、WNT10A的基因编码的标记物中的一种或多种的表达水平更高表明所述样品具有结直肠癌细胞。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述样品得自受试者。

3.根据权利要求2所述的方法，其中所述受试者为人。

4.根据权利要求3所述的方法，其中所述样品为体液。

5.根据权利要求4所述的方法，其中所述体液为血清。

6.根据权利要求1所述的方法，其中所述试剂为蛋白。

7.根据权利要求6所述的方法，其中所述试剂为抗体。

8.根据权利要求1所述的方法，其中所述试剂为核酸。

9.根据权利要求8所述的方法，其中所述核酸为DNA分子。

10.根据权利要求8所述的方法，其中所述核酸分子的长度为约10-500个核苷酸。

11.根据权利要求1所述的方法，其中所述试剂具有连接到其上的可检测物质。

12.根据权利要求1所述的方法，包括：a)将所述样品与检测由基因SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D_1024、MMP7、MMP12、NMU、WNT10A编码的标记物的表达的一种或多种试剂接触；b)将非癌性细胞与得自a)的所述一种或多种试剂接触；以及c)将所述样品中所述标记物的表达水平与所述非癌性细胞中所述标记物的表达水平进行比较，其中与所述非癌性细胞相比在所述样品中由基因SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D_1024、MMP7、MMP12、NMU、WNT10A编码的标记物中的至少一种的表达水平更高表明所述样品具有癌细胞。

13.一种用于检测样品中的癌症的试剂盒，包含特异性结合到由基因SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D_1024、MMP7、MMP12、NMU、WNT10A编码的分子的多种试剂。

14.根据权利要求14所述的试剂盒，其中所述试剂为核酸分子。

15.根据权利要求15所述的试剂盒，其中所述核酸分子为DNA分子。

16.根据权利要求14所述的试剂盒，其中所述试剂为蛋白。

17.根据权利要求17所述的试剂盒，其中所述蛋白为抗体。

18.根据权利要求14所述的试剂盒，其中所述试剂用可检测物质标记。

19.一种检测受试者中的结直肠癌的方法，包括：a)从受试者中获得样品；b)将得自所述受试者的所述样品与检测由选自以下的基因编码的标记物中的一种或多种的表达的一种或多种试剂接触：人丝氨酸蛋白酶抑制剂Kazal4型(SPINK4)、人含LINE-1型转座酶域1(L1TD1)、人溶质运载蛋白家族35成员D3(SLC35D3)、人淋巴细胞抗原6复合物基因座G6D(LY6G6D)、人基质金属肽酶12(巨噬细胞弹性蛋白酶)(MMP12)、人基质金属肽酶12(巨噬细胞弹性蛋白酶)(MMP12)、人载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽1(APOBEC1)、人dickkopf同源物4(非洲爪蟾)(DKK4)、人NADPH氧化酶1(NOX1)、人基质金属肽酶11(溶基质素3)(MMP11)、人环指蛋白43(RNF43)、AGENCOURT_10229596NIH_MGC_141人cDNA克隆IMAGE：6563923 5(BU536065)、人KIAA1199(KIAA1199)、人癌胚抗原相关细胞粘附分子5(CEACAM5)、人无刚毛鳞甲复合体同源物2(果蝇属)(ASCL2)、人绒毛蛋白1(VIL1)、人裸角质膜同源物1(果蝇属)(NKD1)、预测的：人假想LOC729669(LOC729669)、细胞表面关联的人粘蛋白17(MUC17)、人背板胶质乙酰酯酶同源物(果蝇属)(NOTUM)、人胶原XI型α1(COL11A1)、人潘氏细胞特异性防御素α5(DEFA5)、人背板胶质乙酰酯酶同源物(果蝇属)(NOTUM)、人磷脂酶抑制剂(LOC646627)、人NADPH氧化酶组织者1(NOXO1)、人脂质运载蛋白15(LCN15)、人趋化因子(C-C基序)配体24(CCL24)、人胃泌素释放肽(GRP)、人妊娠特异性β1糖蛋白1(PSG1)、人封闭蛋白2(CLDN2)、人潘氏细胞特异性防御素α6(DEFA6)、人神经肽S受体1(NPSR1)、人胱抑素SN(CST1)、人角蛋白23(组蛋白脱乙酰酶诱导)(KRT23)、人基质金属肽酶7(基质溶解素，子宫)(MMP7)、人跨膜结构域4亚家族A成员12(MS4A12)、人角蛋白20(KRT20)或其补体；c)将非癌性细胞与得自b)的所述一种或多种试剂接触；以及d)比较所述非癌性细胞中由选自以下的基因编码的标记物中的一种或多种的表达水平：人丝氨酸蛋白酶抑制剂Kazal4型(SPINK4)、人含LINE-1型转座酶域1(L1TD1)、人溶质运载蛋白家族35成员D3(SLC35D3)、人淋巴细胞抗原6复合物基因座G6D(LY6G6D)、人基质金属肽酶12(巨噬细胞弹性蛋白酶)(MMP12)、人基质金属肽酶12(巨噬细胞弹性蛋白酶)(MMP12)、人载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽1(APOBEC1)、人dickkopf同源物4(非洲爪蟾)(DKK4)、人NADPH氧化酶1(NOX1)、人基质金属肽酶11(溶基质素3)(MMP11)、人环指蛋白43(RNF43)、AGENCOURT_10229596NIH_MGC_141人cDNA克隆IMAGE：6563923 5(BU536065)、人KIAA1199(KIAA1199)、人癌胚抗原相关细胞粘附分子5(CEACAM5)、人无刚毛鳞甲复合体同源物2(果蝇属)(ASCL2)、人绒毛蛋白1(VIL1)、人裸角质膜同源物1(果蝇属)(NKD1)、预测的：人假想LOC729669(LOC729669)、细胞表面关联的人粘蛋白17(MUC17)、人背板胶质乙酰酯酶同源物(果蝇属)(NOTUM)、人胶原XI型α1(COL11A1)、人潘氏细胞特异性防御素α5(DEFA5)、人背板胶质乙酰酯酶同源物(果蝇属)(NOTUM)、人磷脂酶抑制剂(LOC646627)、人NADPH氧化酶组织者1(NOXO1)、人脂质运载蛋白15(LCN15)、人趋化因子(C-C基序)配体24(CCL24)、人胃泌素释放肽(GRP)、人妊娠特异性β1糖蛋白1(PSG1)、人封闭蛋白2(CLDN2)、人潘氏细胞特异性防御素α6(DEFA6)、人神经肽S受体1(NPSR1)、人胱抑素SN(CST1)、人角蛋白23(组蛋白脱乙酰酶诱导)(KRT23)、人基质金属肽酶7(基质溶解素，子宫)(MMP7)、人跨膜结构域4亚家族A成员12(MS4A12)、人角蛋白20(KRT20)或其补体，其中与所述非癌性细胞相比在得自所述受试者的所述样品中由选自以下的基因编码的标记物中的一种或多种的表达水平更高表明所述受试者患有结直肠癌：人丝氨酸蛋白酶抑制剂Kazal4型(SPINK4)、人含LINE-1型转座酶域1(L1TD1)、人溶质运载蛋白家族35成员D3(SLC35D3)、人淋巴细胞抗原6复合物基因座G6D(LY6G6D)、人基质金属肽酶12(巨噬细胞弹性蛋白酶)(MMP12)、人基质金属肽酶12(巨噬细胞弹性蛋白酶)(MMP12)、人载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽1(APOBEC1)、人dickkopf同源物4(非洲爪蟾)(DKK4)、人NADPH氧化酶1(NOX1)、人基质金属肽酶11(溶基质素3)(MMP11)、人环指蛋白43(RNF43)、AGENCOURT_10229596NIH_MGC_141人cDNA克隆IMAGE：6563923 5(BU536065)、人KIAA1199(KIAA1199)、人癌胚抗原相关细胞粘附分子5(CEACAM5)、人无刚毛鳞甲复合体同源物2(果蝇属)(ASCL2)、人绒毛蛋白1(VIL1)、人裸角质膜同源物1(果蝇属)(NKD1)、预测的：人假想LOC729669(LOC729669)、细胞表面关联的人粘蛋白17(MUC17)、人背板胶质乙酰酯酶同源物(果蝇属)(NOTUM)、人胶原XI型α1(COL11A1)、人潘氏细胞特异性防御素α5(DEFA5)、人背板胶质乙酰酯酶同源物(果蝇属)(NOTUM)、人磷脂酶抑制剂(LOC646627)、人NADPH氧化酶组织者1(NOXO1)、人脂质运载蛋白15(LCN15)、人趋化因子(C-C基序)配体24(CCL24)、人胃泌素释放肽(GRP)、人妊娠特异性β1糖蛋白1(PSG1)、人封闭蛋白2(CLDN2)、人潘氏细胞特异性防御素α6(DEFA6)、人神经肽S受体1(NPSR1)、人胱抑素SN(CST1)、人角蛋白23(组蛋白脱乙酰酶诱导)(KRT23)、人基质金属肽酶7(基质溶解素，子宫)(MMP7)、人跨膜结构域4亚家族A成员12(MS4A12)、人角蛋白20(KRT20)或其补体。