[发明专利]脊髓灰质炎病毒株的鉴定

权利要求书

1.一种用于鉴定样品中的脊髓灰质炎病毒株的方法，其中所述方法包括使寡核苷酸与所述样品中的脊髓灰质炎病毒核酸选择性杂交的步骤，其中所述寡核苷酸是以下寡核苷酸中的至少一种：

a)包含SEQ ID NO：1或其互补物的至少12个连续核苷酸的寡核苷酸，并且其中所述寡核苷酸在5′末端或3′末端包含SEQ ID NO：1或其互补物的第1942-1944位的序列；

b)包含SEQ ID NO：1或其互补物的至少12个连续核苷酸的寡核苷酸，并且其中所述寡核苷酸在5′末端或3′末端包含SEQ ID NO：1或其互补物的第3894-3896位的序列；

c)包含SEQ ID NO：2或其互补物的至少12个连续核苷酸的寡核苷酸，并且其中所述寡核苷酸在5′末端或3′末端包含SEQ ID NO：2或其互补物的第1942-1944位的序列；和，

d)包含SEQ ID NO：2或其互补物的至少12个连续核苷酸的寡核苷酸，并且其中所述寡核苷酸在5′末端或3′末端包含SEQ ID NO：2或其互补物的第3894-3896位的序列；

其中，与a)中的寡核苷酸选择性杂交表明存在选自Mahoney1型、Brunhilde、CHAT和Cox的脊髓灰质炎病毒株；与b)中的寡核苷酸选择性杂交表明存在Mahoney1型脊髓灰质炎病毒株；与c)中的寡核苷酸选择性杂交表明存在Sabin1型脊髓灰质炎病毒株；与d)中的寡核苷酸选择性杂交表明存在选自Sabin1型、CHAT和Cox的脊髓灰质炎病毒株。

2.权利要求1的方法，其中所述寡核苷酸包含相对于SEQ ID NO：1和2或其互补物的错配。

3.权利要求2的方法，其中所述错配在SEQ ID NO：1的第1940位、第1946位、第3892位或第3898位上。

4.权利要求1-3任一项的方法，其中所述寡核苷酸的选择性杂交通过扩增测定或扩增-连接测定来检测。

5.权利要求4的方法，其中所述方法包括以下步骤：

a)用包括正向引物和反向引物的引物对扩增所述样品中的脊髓灰质炎病毒核酸的至少一部分，所述正向引物为以下引物中的至少一种：

(i)包含序列：5’-CCCTTTGACTTAAGTHCCAC-3’的至少12个连续核苷酸和3′末端的正向引物，其中H是不能与C碱基配对的核苷酸；

(ii)包含序列：5’-CCCTTTGACTTAAGTHCAAA-3’的至少12个连续核苷酸和3′末端的正向引物，其中H是不能与C碱基配对的核苷酸；

(iii)包含序列：5’-CCATGGTGTTCTTTTVTGTG-3’的至少12个连续核苷酸和3′末端的正向引物，其中V是不能与A碱基配对的核苷酸；

(iv)包含序列：5’-CCATGGTGTTCTTTTVTTTT-3’的至少12个连续核苷酸和3′末端的正向引物，其中V是不能与A碱基配对的核苷酸；

(v)包含序列：5’-GATTTACTCAGCAGAVTAGC-3’的至少12个连续核苷酸和3′末端的正向引物，其中V是不能与A碱基配对的核苷酸；

(vi)包含序列：5’-GATTTACTCAGCAGAVTGGA-3’的至少12个连续核苷酸和3′末端的正向引物，其中V是不能与A碱基配对的核苷酸；

(vii)包含序列：5’-AACTCTGTTATTTTGVCGCT-3’的至少12个连续核苷酸和3′末端的正向引物，其中V是不能与A碱基配对核苷酸；和，

(viii)包含序列：5’-AACTCTGTTATTTTGVCTCC-3’的至少12个连续核苷酸和3′末端的正向引物，其中V是不能与A碱基配对的核苷酸；

其中与正向引物配对的反向引物与正向引物(i)、(iii)、(v)和(vii)在包含Mahoney脊髓灰质炎病毒株的序列的参考cDNA模板上产生扩增子，或者与正向引物(ii)、(iv)、(vi)和(viii)在包含Sabin1型脊髓灰质炎病毒株的序列的参考cDNA模板上产生扩增子；和，

b)检测在步骤a)中是否获得了扩增子，其中用正向引物(i)、(iii)、(v)和(vii)中的至少一种产生的扩增子表明存在选自Mahoney、Brunhilde、CHAT和Cox的脊髓灰质炎病毒株；并且，其中用正向引物(ii)、(iv)、(vi)和(viii)中的至少一种产生的扩增子表明存在Sabin1型脊髓灰质炎病毒株。