[发明专利]一种小麦基因组定点改造方法有效
申请号: | 201310279303.7 | 申请日: | 2013-07-04 |
公开(公告)号: | CN103343120A | 公开(公告)日: | 2013-10-09 |
发明(设计)人: | 高彩霞;王延鹏;单奇伟;陈坤玲 | 申请(专利权)人: | 中国科学院遗传与发育生物学研究所 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12N15/82 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
地址: | 100101 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 小麦 基因组 定点 改造 方法 | ||
1.一种实现小麦目的基因中靶标片段上的随机插入和/或随机缺失的基因改造方法,是利用CRISPR/Cas系统在小麦中对目的基因进行改造,该系统包括向导RNA和Cas9核酸酶,其特征在于:所述方法包含以下步骤:使小麦组织中含有向导RNA和Cas9核酸酶,然后在向导RNA和Cas9核酸酶共同作用下,目的基因上的双链靶标片段被剪切,再通过小麦细胞的自身DNA修复功能,最终实现小麦目的基因中靶标片段上的随机插入和/或随机缺失;
所述靶标片段位于所述目的基因上;所述双链靶标片段中的一条链具有如下结构:5’-NX-NGG-3’,N表示A、G、C和T中的任一种,14≤X≤30;
所述向导RNA依次由能够与所述靶标片段互补结合的RNA片段和骨架RNA片段连接而成;所述骨架RNA片段依次由tracrRNA、crRNA嵌合形成类似发夹结构的RNA,所述骨架RNA片段可与Cas9核酸酶结合。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述5’-NX-NGG-3’中,19≤X≤21,具体X为19或20。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:所述向导RNA中能够与所述靶标片段互补结合的RNA片段为能与所述5’-NX-NGG-3’中NX片段互补结合的RNA片段。
4.根据权利要求1-3任一所述的方法,其特征在于:所述向导RNA中骨架RNA片段是由SEQ ID No.3中第386-469位核苷酸所示DNA转录出来的RNA。
5.根据权利要求1-4任一所述的方法,其特征在于:所述使小麦组织中含有向导RNA和Cas9核酸酶的方法为:向小麦组织中直接转入所述向导RNA和带有核定位信号肽的Cas9核酸酶。
6.根据权利要求1-5任一所述的方法,其特征在于:所述使小麦组织中含有向导RNA和Cas9核酸酶的方法为:向小麦组织中导入含有所述向导RNA的表达盒的重组克隆载体和含有所述带有核定位信号肽的Cas9核酸酶的编码基因的重组表达载体,所述向导RNA的表达盒在小麦组织中表达出向导RNA,所述带有核定位信号肽的Cas9核酸酶的表编码基因在小麦组织中表达出带有核定位信号肽的Cas9核酸酶。
7.根据权利要求1-6任一所述的方法,其特征在于:所述向导RNA的表达盒由U6启动子和所述向导RNA的编码基因组成;所述向导RNA的编码基因由所述能与所述靶标序列互补结合的RNA片段的编码基因和所述骨架RNA片段的编码基因组成。
8.根据权利要求1-7任一所述的方法,其特征在于:所述向导RNA的表达盒中启动子为U6启动子时,所述靶标片段的一条链具有如下结构:5’-G-NX-NGG-3’,N及X与权利要求1或2中定义相同。
9.根据权利要求1-8任一所述的方法,其特征在于:所述带有核定位信号肽的Cas9核酸酶的编码基因中,所述Cas9核酸酶的编码基因的核苷酸序列如SEQ ID No.1中第37-4161位核苷酸所示。
10.根据权利要求1-9任一所述的方法,其特征在于:所述带有核定位信号肽的Cas9核酸酶的编码基因的核苷酸序列如SEQ ID No.1中第7-4212位核苷酸所示。
11.根据权利要求1-10任一所述的方法,其特征在于:所述小麦组织为小麦原生质体。
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