[发明专利]检测人XPD基因热点突变位点的方法、引物和试剂盒有效
申请号: | 201310457040.4 | 申请日: | 2013-09-30 |
公开(公告)号: | CN103540658A | 公开(公告)日: | 2014-01-29 |
发明(设计)人: | 薛群;李文静;王淑一;徐建成 | 申请(专利权)人: | 杭州艾迪康医学检验中心有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州裕阳专利事务所(普通合伙) 33221 | 代理人: | 应圣义 |
地址: | 310023 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 xpd 基因 热点 突变 方法 引物 试剂盒 | ||
1.用于检测检测人XPD基因热点突变位点的引物,所述引物包括:
(1)一对用于扩增人XPD基因第23外显子的特异性外侧引物SEQ NO1和SEQ NO2,其碱基序列为:
SEQ NO1:TCTGGATTATACGGACATCTC;
SEQ NO2:Biotin-TCACCTGACTTCATAAGACCT
(2) 一条特异性内侧测序引物SEQ NO3,其碱基序列为:
SEQ NO3:GCTAGAATCAGAGGAGACG.。
2.如权利要求1所述的引物,其特征在于,所述突变位点为Lys751Gln。
3.一种用于检测检测人XPD基因热点突变位点的方法,所述方法包括:
(i)提取样品中的DNA;
(ii)利用一对特异性外侧扩增引物SEQ NO1和SEQ NO 2,进行PCR扩增,获得扩增产物,其中SEQ NO1:TCTGGATTATACGGACATCTC;SEQ NO2:Biotin-TCACCTGACTTCATAAGACCT;
(iii)将(ii)中的扩增产物进行电泳鉴定,确定是否扩增成功;
(iv)若扩增成功,利用一条特异性内侧测序引物SEQ NO3对所述扩增产物进行焦磷酸测序,获得所述扩增产物的基因序列,其中 SEQ NO3:GCTAGAATCAGAGGAGACG.;
(v)将所述基因序列与人XPD基因第23外显子野生型基因序列进行比对,判断是否存在热点突变位点。
4.如权利要求3所述的方法,步骤(ii)的PCR扩增反应条件为94℃ 5min;98℃ 30s、 58℃ 30s、68℃ 30s,35个循环;最后68℃ 5min。
5.一种用于检测人XPD基因热点突变位点的试剂盒,包括血液DNA抽提试剂、无水乙醇、PCR扩增反应液、阳性对照品、阴性对照品和空白对照品以及焦磷酸测序反应液,其特征在于:所述PCR扩增反应液包括一对用于扩增人XPD基因第23外显子的外侧特异性扩增引物SEQ NO1和SEQ NO2,其碱基序列为:
SEQ NO1:TCTGGATTATACGGACATCTC;
SEQ NO2:Biotin-TCACCTGACTTCATAAGACCT
所述焦磷酸测序反应液包括一条内侧特异性测序引物SEQ NO3,其碱基序列为:
SEQ NO3:GCTAGAATCAGAGGAGACG.。
6.如权利要求5所述的试剂盒,所述PCR扩增反应液还包括2*PCR Buffer、dNTPs、KOD FX DNA Polymerase和ddH2O。
7.如权利要求5所述的试剂盒,所述阳性对照品为含有人XPD基因纯合突变样本DNA的溶液,所述阴性对照品ddH2O,所述空白对照品为生理盐水或不加任何物质。
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