[发明专利]利用胃息肉和胃癌特异性甲基化检测胃息肉和胃癌标记基因的方法

说明书

技术领域

本发明涉及多配体聚糖-2(syndecan，SDC2；NM_002998)基因作为胃息肉和胃癌特异性的甲基化生物标记物的新用途，并且更具体地，涉及多配体聚糖-2基因作为生物标记物的用途，其使得能够通过测量多配体聚糖-2基因的甲基化水平在早期阶段诊断出胃息肉和胃癌。

背景技术

即使医学发展到今天，癌症患者，特别是实体瘤患者(除了血癌患者以外)的5年存活率仍小于50％，并且所有癌症患者中约2/3在晚期被诊断出来，几乎所有都在癌症诊断后的2年内死亡。在癌症治疗中这样差的结果不仅是治疗方法的问题，还是由于这样的事实，即不容易在早期诊断癌症和准确地诊断晚期癌症，并在癌症治疗后对癌症患者进行随访。

在目前的临床实践中，癌症的诊断是由后询问病史、体检及临床评估后进行组织活检，而如果怀疑是癌症，随后进行射线检测和内窥镜检查来确认的。然而，由现有临床实践对癌症的诊断只有当癌细胞的数目超过十亿并且癌的直径大于1cm时才可能。在这种情况下，癌细胞已经具有转移能力，并且其至少一半已经转移。同时，用于监测从癌直接或间接产生的物质的肿瘤标记物被用于癌症筛查，但是它们由于准确性有限而引起混乱，因为其中高达约半数即使在癌症存在时也显示为正常，它们即使在没有癌症时也表现为阳性。此外，主要用于癌症治疗的抗癌剂的问题在于只有当癌体积很小时才显示出效果。

之所以难以诊断和治疗癌症是因为癌细胞是高度复杂和可变的。癌细胞过度生长并且连续地侵入周围组织以及转移到远端器官导致死亡。尽管有免疫机制或抗癌治疗的攻击，但癌细胞仍旧存活，不断地发展并且选择性繁殖最适宜存活的细胞群。癌细胞是具有高度生存能力的生物体，通过大量基因的突变而产生。为了使一个细胞转变为癌细胞并发展成临床上可检测到的恶性癌症肿块，必须发生大量基因的突变。因此，为了从根本上诊断并治疗癌症，在基因水平的方法是必要的。

最近，已积极尝试用遗传分析来诊断癌症。最简单的典型方法是通过PCR检测血液中ABL：BCR融合基因(白血病的遗传特征)的存在。该方法具有大于95％的准确率，并且在使用这个简易的基因分析来诊断并治疗慢性髓细胞性白血病后，这一方法被用于结果评估和后续研究。但是，这种方法的缺点在于它只能适用于某些血癌。

此外，已尝试另一种方法，其中通过RT-PCR和印迹法检测由癌细胞表达的基因的存在，从而诊断血细胞中癌细胞的存在。但是，这种方法的缺点在于它只能适用于包括前列腺癌和黑色素瘤在内的某些癌症，并且具有较高的假阳性率。此外，难以对该方法中的检测和读数标准化，并且它的效用也很有限(Kopreski,M.S.et al.,Clin.Cancer Res.,5:1961,1999；Miyashiro,I.et al.,Clin.Chem.,47:505,2001)。

最近，已积极尝试使用血清或血浆中的DNA的基因检测。这是一种检测从癌细胞中分离并释放到血液中并游离DNA的形式存在于血清中的癌症相关基因的方法。据发现，血清中的DNA浓度在实际癌症患者中比正常人中增加5-10倍，并且这种增加的DNA大多从癌细胞释放。使用这样的从癌细胞中分离的DNA来分析癌症特异性基因的异常，例如原癌基因和肿瘤抑制基因的突变、缺失和功能丧失，允许诊断癌症。在这项工作中，出现了通过检查血清中突变的K-ras癌基因、p53肿瘤抑制基因和p16基因中的启动子甲基化，以及微卫星的标记和不稳定性来诊断肺癌、头颈癌、乳腺癌、结肠癌和肝癌的积极尝试(Chen,X.Q.et al.,Clin.Cancer Res.,5:2297,1999；Esteller,M.et al.,Cancer Res.,59:67,1999；Sanchez-Cespedes,M.et al.,Cancer Res.,60:892,2000；Sozzi,G.et al.,Clin.Cancer Res.,5:2689,1999)。