[发明专利]一种SLCO1B1 521T>C的检测引物及其组合物有效

专利信息
申请号: 201510652715.X 申请日: 2015-10-10
公开(公告)号: CN105255863B 公开(公告)日: 2019-08-23
发明(设计)人: 汪大为 申请(专利权)人: 北京晋祺生物科技有限公司
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/6844
代理公司: 天津协众信创知识产权代理事务所(普通合伙) 12230 代理人: 刘斌
地址: 100039 北京市海淀*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 slco1b1 521 检测 引物 及其 组合
【说明书】:

发明属于生物检测技术领域,具体涉及一种SLCO1B1 521T>C的检测引物,所述检测引物如下:正向外侧引物F3T:SEQ ID NO:1;反向外侧引物B3T:SEQ ID NO:2;正向内侧引物FIPT:SEQ ID NO:3;反向内侧引物BIPT:SEQ ID NO:4;正向外侧引物F3C:SEQ ID NO:5;反向外侧引物B3C:SEQ ID NO:6;正向内侧引物FIPC:SEQ ID NO:7;反向内侧引物BIPC:SEQ ID NO:8。本发明步骤简单、扩增反应快速、高效、特异性高、鉴定简便,使该技术有着更广阔的应用前景。

技术领域

本发明属于生物检测技术领域,具体涉及一种SLCO1B1 521T>C的检测引物及其组合物。

背景技术

由SLCO1B1基因编码的有机阴离子转运多肽1B1(OATP1B1,又称 OATP-C、OATP2或LST1),在肝细胞摄取和清除内源性和外源性物质如胆汁酸、非结合型胆红素、甲状腺素、他汀类药物、瑞格列奈、依那普利拉、替莫普利、缬沙坦、奥美沙坦、甲氨蝶呤和伊立替康活性代谢产物SN-38等中发挥重要作用。该基因第5外显子521T>C(rs4149056,Val174Ala)多态性是亚洲人群中的主要遗传变异,等位基因频率为10~15%,携带521C等位基因的SLCO1B1所编码的OATP1B1会显著降低其对底物的摄取能力,使他汀类药物如普伐他汀、阿托伐他汀和罗苏伐他汀等的血药浓度升高。他汀类药物的严重不良反应包括肝功能下降和横纹肌溶解症等。因此,携带521C等位基因的患者应用辛伐他汀、西立伐他汀时肌病的发生风险显著增加。为降低他汀类药物严重不良反应的发生风险,《药物代谢酶和药物作用靶点基因检测技术指南(试行)》中也建议“临床上根据SLCO1B1基因型选择他汀类药物进行治疗。”

现阶段用来检测rs4149056位点的方法有很多,主要集中于PCR-直接测序法、Taqman荧光PCR法、HRM法、核酸杂交法等等,这些方法虽然都能以相对较短的时间准确得检测rs4149056,但是都需要依赖比较昂贵的仪器和/或试剂,其中测序法操作耗时长且灵敏度低;高分辨率溶解曲线法(HRM法)对设备要求较高,临床推广存在一定的困难;传统荧光定量PCR法在临床上应用较为广泛,但该方法对样本数量以及多态性分布有一定要求,样本量少时不能准确检测。CN 102021239A公开了一种SLCO1B1基因SNP检测特异性引物和液相芯片,然而这种方法不仅操作繁琐,检测耗时较长,还需要昂贵的检测设备。因此这些方法都比较难以广泛推广开来,尤其是在偏远的经济欠发达地区。然而,从目前来看,这种检测需求又非常巨大,因此,有必要寻求一种检测方法,既能做到费用低廉,又能实现快速准确得检测。

环介导的等温扩增(LAMP)技术是日本科学家于2000年提出的一种等温扩增技术,其主要特点是针对靶基因的6个区域设计4条特异引物,在链置换 DNA聚合酶(Bst DNApolymerase)的作用下进行恒温扩增,仅需15-90分钟即可产生109-1010数量级的产物。具有敏感性高、特异性好、操作简便、成本低廉且结果易于判定的优点。

发明内容

本发明为了克服上述方法的缺陷,提供一种SLCO1B1 521T>C的检测引物及其组合物,具有敏感性高、特异性好和操作简便等优点。

为达到此发明的目的,本发明采用以下技术方案:

第一方面,本发明提供一种SLCO1B1基因的检测引物组,所述检测引物组如下:

正向外侧引物F3T:SEQ ID NO:1: TAAGTAGAATAATTAAGAGTTTACAAGT;

反向外侧引物B3T:SEQ ID NO:2:CCTTCTTTAGCGAAATCATCAA;

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