[发明专利]一种药物性耳聋的检测引物组、其构成的反应体系及应用在审
申请号: | 201510944743.9 | 申请日: | 2015-12-16 |
公开(公告)号: | CN105586402A | 公开(公告)日: | 2016-05-18 |
发明(设计)人: | 张井存;汪大为 | 申请(专利权)人: | 北京晋祺生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京世誉鑫诚专利代理事务所(普通合伙) 11368 | 代理人: | 郭官厚 |
地址: | 100039 北京市海淀*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 药物性 耳聋 检测 引物 构成 反应 体系 应用 | ||
技术领域
本发明属于生物检测技术领域,具体涉及一种药物性耳聋的检测引物组、 其构成的反应体系及应用。
背景技术
药物中毒性耳聋(简称药物性耳聋),是指患者因使用或接触某些耳毒性药 物而造成的耳聋,这些药物(包括氨基糖苷类抗菌素、非氨基糖苷类抗菌素、 水杨酸盐等)均对人类听觉神经具有毒副作用,可破坏耳蜗,一般造成双侧、 永久性耳聋,多不可逆。
根据中国2006年第二次全国残疾人抽样调查结果显示,听力残疾患者人数 约2004万人,占全国8296万残疾人总数的24.16%,其中药物致聋的人数多达 800万。其中,氨基糖苷类抗生素的不恰当使用是造成药物性耳聋发生的最常 见因素,这类抗生素包括常见的链霉素、庆大霉素等。另外有研究结果表明, 人类线粒体基因突变的发生与药物性耳聋密切相关。在中国人群中,线粒体基 因的A1555G、C1494T这两个位点突变的发生频率高达4%。A1555G突变和 C1494T突变会在12SrRNA的高度保守的A位形成新的1494C-G1555或 1494U-A1555碱基对。这些改变使得12SrRNA在二级结构上与细菌的 16SrRNA的相应区域的二级结构更加相似,导致糖苷类药物与之发生“不应该” 的结合,引起细胞膜上的Na+,K+-ATP泵功能障碍,造成毛细胞损伤,导致药 物性听力受损甚至耳聋。
目前用于检测这两个位点突变的方法有很多种,如Sanger测序法,这种方 法可以很直观得得到目的位点的突变情况,然而操作复杂,需要两次PCR和大 量的纯化工作,并且费用高昂,耗时较长,不适合大范围推广使用;等位基因 特异性PCR法,这种方法通过设计突变型和野生型特异的PCR引物,通过电 泳比较野生型和突变型PCR产物的大小不同以判定检测样本的突变状况,优点 是费用低廉,然而大规模检测时样本量较大,同时进行大量的电泳操作就会变 得非常繁琐,而且容易造成交叉污染;荧光定量PCR法灵敏度高,不需要人工 检测,因此目前应用比较广泛,然而它依然不能摆脱对昂贵的设备的依赖,同 时,用于检测的探针也是一笔不小的支出。因此,非常有必要开发一种既能快 速准确又能价格低廉的检测方法。
环介导的等温扩增(LAMP)技术是日本科学家于2000年提出的一种等温 扩增技术,其主要特点是针对靶基因的6个区域设计4条特异引物,在链置换 DNA聚合酶(BstDNApolymerase)的作用下进行恒温扩增,仅需15-90分钟 即可产生109-1010数量级的产物。LAMP反应对模板DNA的质量要求远没有 PCR反应严格,因此DNA的粗提物就可以直接作为检测模板,比起以PCR为 基础的检测方法具有更大的优势,可免去DNA提取的成本和繁琐操作的步骤, 尤其是在大量样本的检测中,这种优势就更加明显。同PCR反应一样,LAMP 的反应也需要引物3端与模板的严格配对,具有敏感性高、特异性好、操作简 便、成本低廉且结果易于判定的优点。
发明内容
本发明为了克服上述方法的缺陷,提供一种药物性耳聋的检测引物组、其 构成的反应体系及应用,所述检测体系具有敏感性高、特异性好和操作简便等 优点。
为达到此发明的目的,本发明采用以下技术方案:
第一方面,本发明提供一种药物性耳聋的检测引物组,其特征在于,所述 检测引物组如下:
正向外侧引物F3C:SEQIDNO:1:GGCAAGAAATGGGCTACA;
反向外侧引物B3C:SEQIDNO:2:CGTAGGGGTTTTAGTTAAATGTC;
正向内侧引物FIPC:SEQIDNO:3: TGCTAAATCCACCTTCGACCTCTACCCCAGAAAACTACGAT;
反向内侧引物BIPC:SEQIDNO:4: TAAGAGTAGAGTGCTTAGTTGAACACTTTGAAGTATACTTGAGGATG;
正向外侧引物F3T:SEQIDNO:5:AAACTTAAGGGTCGAAGGTGG;
反向外侧引物B3T:SEQIDNO:6:CTGGTTCGTCCAAGTGCA;
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