[发明专利]一种数字病理全切片图像检索方法有效
申请号: | 201610056048.3 | 申请日: | 2016-01-27 |
公开(公告)号: | CN105740378B | 公开(公告)日: | 2020-07-21 |
发明(设计)人: | 姜志国;麻义兵;张浩鹏;谢凤英;郑钰山 | 申请(专利权)人: | 北京航空航天大学 |
主分类号: | G06F16/583 | 分类号: | G06F16/583;G16H30/00;G06K9/46;G06K9/62 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 100191*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 数字 病理 切片 图像 检索 方法 | ||
1.一种数字病理全切片图像检索方法,应用于数字病理全切片图像数据库,其特征在于包括以下步骤:
(1)在线下训练阶段,对数据库中全切片提取离散SIFT特征点的位置以及SIFT特征向量;
(2)使用LDA模型计算步骤(1)得到的每个SIFT特征向量得到对应的SIFT特征点的语义特征值;
(3)用有重叠的滑窗方法在全切片中选取备选区域,统计位于每个备选区域内的所有SIFT特征点的步骤(2)得到的语义特征值,得到对应备选区域的语义表示向量;
(4)在线上检索阶段,将查询图像视为一个区域,使用步骤(1)到步骤(3)中的方法得到查询图像的语义表示向量;
(5)计算步骤(4)得到的查询图像的语义表示向量与步骤(3)得到的所有备选区域的语义表示向量的余弦距离,返回距离最小的若干备选区域,以及这些区域所在的全切片和区域在全切片中的位置。
2.根据权利要求1所述的一种数字病理全切片图像检索方法,其特征是:所述步骤(2)使用LDA模型计算步骤(1)得到的每个SIFT特征向量对应的SIFT特征点的语义特征值,其方法是采用公式
ti=FK(fi)=k,k∈1,2,…,K (2)
其中ti表示数据库中第i个SIFT特征点的语义特征值,FK表示参数为正整数K的LDA模型,fi表示数据库中第i个SIFT特征点的SIFT特征向量,ti是一个取值范围为1到K之间的正整数,ti的位置与fi相同。
3.根据权利要求1所述的一种数字病理全切片图像检索方法,其特征是:所述步骤(3)以有重叠的滑窗方法在全切片中选取备选区域,统计位于每个备选区域内的所有SIFT特征点的步骤(2)得到的语义特征值,得到对应备选区域的语义表示向量,其公式为
Li=[Si,Xi,Yi],Ri=[n1(i),n2(i),…,nK(i)], (3)
其中Li表示数据库中第i个备选区域的位置位于第Si个全切片中,左上角横坐标为Xi,纵坐标为Yi,Ri表示数据库中第i个备选区域的语义表示向量,是一个K维直方图向量,nk(i)表示在数据库中第i个备选区域内主题为k的SIFT特征点个数,计算公式为
其中,SIFT特征点j位于第sj个全切片中,xj表示SIFT特征点j的横坐标,yj表示SIFT特征点j的纵坐标,tj表示取值为k的正整数,1(tj=k)当且仅当tj=k时为1,其他情况为0,W表示备选区域的宽度。
4.根据权利要求1所述的一种数字病理全切片图像检索方法,其特征是:所述步骤(5)计算步骤(4)得到的查询图像的语义表示向量与步骤(3)得到的所有备选区域的语义表示向量的余弦距离,di表示查询图像的语义表示向量RQ与数据库中第i个备选区域的语义表示向量Ri的余弦距离,对所有备选区域按照di由小到大顺序排序,定义d(i)表示排序后的第i个备选区域的距离,L(i)表示排序后的第i个备选区域的位置,则L(1),…,L(T)即为检索结果,其中T为正整数表示返回结果个数。
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