[发明专利]用于测定非小细胞肺癌预后的诊断方法

权利要求书

1.一种预测就肺癌治疗的患者中的疾病后果的方法，所述方法包括步骤：

a)提供来自患者的测试样品；

b)测定所述测试样品中细胞周期蛋白E1基因的拷贝数；

c)针对基线拷贝数2比较所述测试样品中所述细胞周期蛋白E1基因的拷贝数，从而测 定所述测试样品中关于所述细胞周期蛋白E1基因的拷贝数增益的存在或不存在；和

d)基于所述测试样品中关于所述细胞周期蛋白E1基因的拷贝数增益的存在或不存 在，当与在所述细胞周期蛋白E1基因中不具有拷贝数增益的患者中疾病后果的基线测量比 较时，将所述患者鉴定为具有不良疾病后果的增加危险，其中所述细胞周期蛋白E1基因中 的拷贝数增益的存在预测不良疾病后果。

2.权利要求1的方法，其中所述不良疾病后果是当与不具有关于所述细胞周期蛋白E1 基因的拷贝数增益的患者的总体存活时间比较时减少的总体存活时间、和当与不具有关于 所述细胞周期蛋白E1基因的拷贝数增益的患者的总体存活时间比较时更短的复发时间中 的至少一个。

3.一种预测就肺癌治疗的患者中的治疗后果的方法，所述方法包括步骤：

a)提供来自患者的测试样品；

b)测定关于细胞周期蛋白E1基因的拷贝数增益的存在或不存在；和

c)基于关于所述细胞周期蛋白E1基因的拷贝数增益的存在或不存在，当与不具有关 于所述细胞周期蛋白E1基因的拷贝数增益的患者的总体存活时间比较时，测定所述患者是 具有减少的总体存活时间还是更短的复发时间的更高危险。

4.权利要求1-3中任一项的方法，其中所述细胞周期蛋白E1基因位于染色体19，34.7 Mb-35.6Mb。

5.权利要求1-3中任一项的方法，其中所述测试样品包含组织样品。

6.权利要求5的方法，其中所述组织样品包含血液样品、肿瘤组织或可疑肿瘤组织、薄 层细胞学样品、细针抽吸物样品、肺洗涤样品、胸腔积液样品、新鲜冷冻组织样品、石蜡包埋 的组织样品或由外周血样品中任何一种产生的提取物或加工的样品。

7.权利要求5的方法，其中所述组织样品包括肺组织样品或包含循环肿瘤细胞的外周 血样品。

8.权利要求1-3中任一项的方法，其中所述测定步骤(b)通过原位杂交执行。

9.权利要求8的方法，其中所述原位杂交用荧光标记的核酸探针执行。

10.权利要求8的方法，其中所述原位杂交用至少2种核酸探针执行。

11.权利要求8的方法，其中所述原位杂交用肽核酸探针执行。

12.权利要求1-3中任一项的方法，其中所述测定步骤(b)通过聚合酶链反应执行。

13.权利要求1-3中任一项的方法，其中所述测定步骤(b)通过核酸测序测定执行。

14.权利要求1-3中任一项的方法，其中所述测定步骤(b)通过核酸微阵列测定执行。

15.权利要求1-3中任一项的方法，其中所述肺癌是非小细胞肺癌。

16.权利要求1-3中任一项的方法，其中所述癌症选自鳞状细胞癌、大细胞癌和腺癌。

17.权利要求1-3中任一项的方法，其中所述患者用化学疗法、放射、手术或其任何组合 进行治疗。

18.一种选择用于患有肺癌的患者的治疗的方法，所述方法包括步骤：

a)提供来自患者的测试样品，其中用化学治疗剂的治疗是用于所述患者的至少一个 治疗选项；

b)测定所述测试样品中关于细胞周期蛋白E1基因的拷贝数；

c)针对基线拷贝数2比较所述测试样品中所述细胞周期蛋白E1基因的拷贝数，从而测 定所述测试样品中关于细胞周期蛋白E1的拷贝数增益的存在或不存在；和

d)基于步骤c)中的比较，确定化学疗法治疗方案。