[发明专利]一种分子标签核酸检测方法在审
申请号: | 201710009220.4 | 申请日: | 2017-01-06 |
公开(公告)号: | CN106755454A | 公开(公告)日: | 2017-05-31 |
发明(设计)人: | 祝云英 | 申请(专利权)人: | 杭州杰毅麦特医疗器械有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 杭州千克知识产权代理有限公司33246 | 代理人: | 黎双华 |
地址: | 310000 浙江省杭州市*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 分子 标签 核酸 检测 方法 | ||
1.一种分子标签核酸检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)待测脱氧核糖核酸(DNA)中加入DNA末端补平酶和dNTP,补平DNA末端,并在DNA的3’端增加碱基A;
2)直接往步骤1反应体系中加入DNA连接试剂,使步骤1所得产物与带有多个分子标签的DNA接头连接;
3)使用通用引物进行PCR扩增;
4)将步骤3所得扩增产物和捕获探针进行杂交,得到捕获产物;
5)捕获产物用带有样本识别作用的分子标签引物进行扩增,最终产物用于高通量基因测序;
6)测序后,通过接头两端序列可以获知DNA两端在染色体的起始位置,综合分子标签、DNA片段的起始位置双重校正因素得出测序结果:1.标签序列一致,DNA起始位置一致的为一个来源的DNA;2.标签一致,起始位置不一致的为不同模板DNA;3.标签不一致,起始位置一致为不同模板DNA;4.标签不一致,起始位置不一致为不同模板来源DNA。
2.根据权利要求1所述的分子标签核酸检测方法,其特征在于,步骤1中DNA末端补平酶为T4 DNA聚合酶、Klenowexo-、T4 DNA磷酸激酶(T4 DNA PNK)、Taq聚合酶或Klenow酶中的一种或多种。
3.根据权利要求2所述的分子标签核酸检测方法,其特征在于,步骤1反应条件是37℃20分钟,反应后无需纯化。
4.根据权利要求1所述的分子标签核酸检测方法,其特征在于,步骤2所述DNA连接试剂主要由T4DNA连接酶和DNA接头组成,DNA接头由共同序列、分子标签序列组成,每一个样本加入多个分子标签。
5.根据权利要求4所述的分子标签核酸检测方法,其特征在于,步骤2反应条件是20℃15~20分钟,反应后无需纯化。
6.根据权利要求1所述的分子标签核酸检测方法,其特征在于,步骤3使用和DNA接头通用部分互补的引物,进行PCR扩增。
7.根据权利要求1所述的分子标签核酸检测方法,其特征在于,步骤4扩增产物和需要捕获区域的探针进行杂交,捕获探针为DNA或RNA探针。
8.根据权利要求1所述的分子标签核酸检测方法,其特征在于,步骤5用带有唯一分子标签的引物对样本进行扩增,此标签用来区分具体样本。
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