[发明专利]检测22个位点耳聋基因多态性的SNaPshot试剂的应用在审
申请号: | 201710418732.6 | 申请日: | 2017-06-06 |
公开(公告)号: | CN107190065A | 公开(公告)日: | 2017-09-22 |
发明(设计)人: | 赵薇薇;胡昌明;徐艳艳;陈白雪;贺书香;刘晶星;于世辉 | 申请(专利权)人: | 广州金域医学检验中心有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 广东翰锐律师事务所44442 | 代理人: | 陈业胜 |
地址: | 510220 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 22 个位 耳聋 基因 多态性 snapshot 试剂 应用 | ||
1.引物组在制备检测多种耳聋基因多态性的SNaPshot试剂中的应用,引物具体序列为:
管1的扩增引物:
管2的扩增引物:
管1的测序引物:
管2的测序引物:
2.权利要求1所述的应用,其中测序引物浓度比例如下:
管1各测序引物的浓度:
管2各测序引物的浓度:
3.权利要求1或2任一项所述的试剂盒,其中扩增引物在进行扩增时,扩增试剂比例如下:
其中,扩增引物的比例均为1:1。
4.权利要求1或2任一项所述的试剂盒,扩增产物在进行微测序时,测序试剂比例如下:
5.一种利用Snapshot技术一次性检测多个耳聋基因多态性位点的非诊断科研方法,具体包括步骤:
DNA提取:
以人血的采集样本进行DNA提供,具体参考公司有关《血液基因组DNA提取标准操作流程》,提取完毕的DNA计算其浓度并稀释至5-10μg/mL;
试剂准备:
a)配置二倍的Master Mix,这其中包括dNTP、MgCl2、热启动超保真DNA聚合酶、缓冲液,室温融化后,短暂离心;准备好合适数量的PCR反应管;
b)配制权利要求1所列的扩增引物混合物:各引物的比例均为=1:1,震荡混匀;短暂离心后备用;
c)反应体系配制
d)震荡混匀,短暂离心后,分装23μL至标记好的PCR反应管。转移至标本制备区;
加样
a)若样品及质控品保存在-20℃,使用前置室温解冻,并短暂离心;
b)向分装好的PCR反应管中加入10ngDNA模板,并进行稀释;
c)盖好管盖后,震荡混匀,短暂离心,转移至PCR扩增区;
PCR扩增:
置PCR管放于PCR仪上。反应程序设置如下:
95℃5min;95℃30s;55℃30s;72℃1min;45个循环;72℃5min;25℃保温;
PCR扩增产物纯化:
取2ul的ExoSAP-IT分装到200ul EP管,每管加入PCR产物5ul,混匀微离,按以下程序进行PCR:7ul 37℃15min;80℃15min;4℃forever
SNaPshot PCR扩增
a)反应结束后取出8连管,配制权利要求1所列的测序引物混合物,比例如下:
b)按以下体系配置:
c)对纯化后2管的扩增产物分别进行Snapshot延伸,加入1ul纯化产物,混匀微离,按以下程序进行PCR:96℃10s;96℃10s;50℃5s;60℃30s;25个循环;4℃保温;
SNE产物纯化:
a)往SNaPshot PCR产物中加入FastAP 1ul、buffer2 ul、7ul水、10ulSNaPshot PCR产物,按以下程序进行PCR:
b)37℃10min;75℃5min;1个循环;4℃保温;
电泳:
SAP处理完的产物1ul+8.8ul HiDi+0.2ul 120 Liz 95℃变性3min,冰上冷却,上机结果分析与解释:
分析采用GENEMAPPERID V4.1软件进行初步分析,确定SNP位点;
分析完毕的结果需要保存,GENEMAPPERID V4.1软件文件格式及SNaPshot峰图各保存一份;
GeneMapper4.1软件分析。
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