[发明专利]检测22个位点耳聋基因多态性的SNaPshot试剂的应用在审

专利信息
申请号: 201710418732.6 申请日: 2017-06-06
公开(公告)号: CN107190065A 公开(公告)日: 2017-09-22
发明(设计)人: 赵薇薇;胡昌明;徐艳艳;陈白雪;贺书香;刘晶星;于世辉 申请(专利权)人: 广州金域医学检验中心有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 广东翰锐律师事务所44442 代理人: 陈业胜
地址: 510220 广东省*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 检测 22 个位 耳聋 基因 多态性 snapshot 试剂 应用
【权利要求书】:

1.引物组在制备检测多种耳聋基因多态性的SNaPshot试剂中的应用,引物具体序列为:

管1的扩增引物:

管2的扩增引物:

管1的测序引物:

管2的测序引物:

2.权利要求1所述的应用,其中测序引物浓度比例如下:

管1各测序引物的浓度:

管2各测序引物的浓度:

3.权利要求1或2任一项所述的试剂盒,其中扩增引物在进行扩增时,扩增试剂比例如下:

其中,扩增引物的比例均为1:1。

4.权利要求1或2任一项所述的试剂盒,扩增产物在进行微测序时,测序试剂比例如下:

5.一种利用Snapshot技术一次性检测多个耳聋基因多态性位点的非诊断科研方法,具体包括步骤:

DNA提取:

以人血的采集样本进行DNA提供,具体参考公司有关《血液基因组DNA提取标准操作流程》,提取完毕的DNA计算其浓度并稀释至5-10μg/mL;

试剂准备:

a)配置二倍的Master Mix,这其中包括dNTP、MgCl2、热启动超保真DNA聚合酶、缓冲液,室温融化后,短暂离心;准备好合适数量的PCR反应管;

b)配制权利要求1所列的扩增引物混合物:各引物的比例均为=1:1,震荡混匀;短暂离心后备用;

c)反应体系配制

d)震荡混匀,短暂离心后,分装23μL至标记好的PCR反应管。转移至标本制备区;

加样

a)若样品及质控品保存在-20℃,使用前置室温解冻,并短暂离心;

b)向分装好的PCR反应管中加入10ngDNA模板,并进行稀释;

c)盖好管盖后,震荡混匀,短暂离心,转移至PCR扩增区;

PCR扩增:

置PCR管放于PCR仪上。反应程序设置如下:

95℃5min;95℃30s;55℃30s;72℃1min;45个循环;72℃5min;25℃保温;

PCR扩增产物纯化:

取2ul的ExoSAP-IT分装到200ul EP管,每管加入PCR产物5ul,混匀微离,按以下程序进行PCR:7ul 37℃15min;80℃15min;4℃forever

SNaPshot PCR扩增

a)反应结束后取出8连管,配制权利要求1所列的测序引物混合物,比例如下:

b)按以下体系配置:

试剂 体积(μL) SNaPshot Ready Mix 1.25 ddH2O 4.25 5倍稀释的测序缓冲液1.5 引物混合物 2 total 9.0

c)对纯化后2管的扩增产物分别进行Snapshot延伸,加入1ul纯化产物,混匀微离,按以下程序进行PCR:96℃10s;96℃10s;50℃5s;60℃30s;25个循环;4℃保温;

SNE产物纯化:

a)往SNaPshot PCR产物中加入FastAP 1ul、buffer2 ul、7ul水、10ulSNaPshot PCR产物,按以下程序进行PCR:

b)37℃10min;75℃5min;1个循环;4℃保温;

电泳:

SAP处理完的产物1ul+8.8ul HiDi+0.2ul 120 Liz 95℃变性3min,冰上冷却,上机结果分析与解释:

分析采用GENEMAPPERID V4.1软件进行初步分析,确定SNP位点;

分析完毕的结果需要保存,GENEMAPPERID V4.1软件文件格式及SNaPshot峰图各保存一份;

GeneMapper4.1软件分析。

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