[发明专利]使用MERFISH、扩展显微术和相关技术进行多重成像有效
| 申请号： | 201780082227.7 | 申请日： | 2017-11-08 |
| 公开（公告）号： | CN110168346B | 公开（公告）日： | 2023-03-03 |
| 发明（设计）人： | 庄小威;J·R·莫菲特;王桂萍 | 申请（专利权）人： | 哈佛学院院长及董事 |
| 主分类号： | G01N1/36 | 分类号： | G01N1/36;C12Q1/6806;C12Q1/6834;C12Q1/6841 |
| 代理公司： | 中国贸促会专利商标事务所有限公司 11038 | 代理人： | 张小勇 |
| 地址： | 美国马*** | 国省代码： | 暂无信息 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 使用 merfish 扩展 显微 相关 技术 进行 多重 成像 | ||
1.一种方法，其包括：
将细胞包埋到可膨胀材料中；
将来自细胞的核酸固定至可膨胀材料，其包括将核酸暴露于多种锚定探针，所述多种锚定探针在每种核酸的序列的单个区域处将核酸固定至可膨胀材料，其中每种锚定探针包含与来自细胞的核酸的至少一部分基本上互补的核酸序列和与可膨胀材料反应的部分；
使可膨胀材料膨胀；
将可膨胀材料暴露于多种核酸探针；和
测定核酸探针与固定的核酸的结合。
2.根据权利要求1所述的方法，包括在位于每种核酸的5’末端的单个区域处将核酸固定至可膨胀材料。
3.根据权利要求1所述的方法，包括在位于每种核酸的3’末端的单个区域处将核酸固定至可膨胀材料。
4.根据权利要求1所述的方法，包括在位于每种核酸的中心部分的单个区域处将核酸固定至可膨胀材料。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的方法，其中对每种核酸使用一种独特的锚定探针。
6.根据权利要求1-4中任一项所述的方法，其中对每种核酸使用多种独特的锚定探针。
7.根据权利要求1-4中任一项所述的方法，其中对于每种核酸使用至少5种独特的锚定探针。
8.根据权利要求1-4中任一项所述的方法，其中对于每种核酸使用至少10种独特的锚定探针。
9.根据权利要求1-4中任一项所述的方法，其中多种锚定探针中的至少一些锚定探针包含亚磷酰胺修饰的寡核苷酸。
10.根据权利要求1-4中任一项所述的方法，其中多种锚定探针中的至少一些锚定探针包含多聚dT序列。
11.根据权利要求1所述的方法，其中将细胞包埋到可膨胀材料中包括用可膨胀材料的前体包围细胞，并使可膨胀材料的前体形成围绕细胞的可膨胀材料。
12.根据权利要求11所述的方法，其中可膨胀材料的前体包括单体。
13.根据权利要求11或12中任一项所述的方法，其中使前体形成可膨胀材料包括使前体聚合。
14.根据权利要求11或12中任一项所述的方法，其中使前体形成可膨胀材料包括将前体暴露于交联剂。
15.根据权利要求11或12中任一项所述的方法，其中前体包括丙烯酰胺。
16.根据权利要求11或12中任一项所述的方法，其中前体包括丙烯酸酯。
17.根据权利要求1-4、11或12中任一项所述的方法，其中可膨胀材料包括凝胶。
18.根据权利要求1-4、11或12中任一项所述的方法，其中可膨胀材料包括聚丙烯酰胺。
19.根据权利要求1-4、11或12中任一项所述的方法，其中可膨胀材料包括甲基丙烯酸酯。
20.根据权利要求1-4、11或12中任一项所述的方法，包括使可膨胀材料各向同性地膨胀。
21.根据权利要求1-4、11或12中任一项所述的方法，还包括固定细胞。
22.根据权利要求1-4、11或12中任一项所述的方法，还包括固定细胞，其中固定细胞包括将细胞暴露于多聚甲醛。
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