[发明专利]梅花垂枝性状SNP分子标记及其应用

说明书

本发明公开了梅花垂枝性状SNP分子标记及其应用，具体包括分子标记Marker301243和/或Marker311414，其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示。本发明利用SLAF‑seq技术开发获得2个梅花垂枝性状SNP分子标记Marker301243和Marker311414，并提供了其序列扩增引物和等位特异性PCR引物。所述分子标记Marker301243和/或Marker311414及其引物在鉴定梅花品种时，具有较高的准确性、稳定性且重复性好。将其用于分子辅助选择育种，可实现苗期提早选择，快速鉴定梅花垂枝性状，减少工作量，大大缩短梅花育种时间。

技术领域

本发明涉及分子生物学及植物分子育种领域，具体地说，涉及梅花垂枝性状SNP分子标记及其应用。

背景技术

梅花(Prunus mume Sieb.et Zucc.)隶属于蔷薇科(Rosaceae)李属(Prunus)，是我国十大传统名花之一，具有观赏和使用价值，起源于中国西南部，距今已有3000多年的引种栽培历史(陈俊愉.中国梅花品种图志[M].中国林业出版社,2010)。梅花种类多样，花色花型株型丰富，其中垂枝梅是具有独特株型的梅花九大品种之一，因其别致的树姿兼具花色、花香等其它观赏性状而深受人们喜爱，在园林造景中具有重要的地位。

张杰(张杰.梅花高密度遗传图谱构建及部分观赏性状QTL分析[D].北京林业大学,2016.)利用特异性位点扩增片段测序(SLAF-seq,Specific-Locus AmplifiedFragment Sequencing)技术对梅花进行全基因组范围内的分子标记开发，构建了梅花标记密度最大的一张遗传连锁图谱，并将垂枝性状定位到梅花7号染色体10.54Mb-11.68Mb区间，同时得到10个可能与梅花垂枝性状紧密连锁的SLAF分子标记。

利用高通量测序技术大量开发SNP标记，开发性状连锁的分子标记进行植株的初期筛选，达到分子辅助育种的目的，可大大缩短育种的周期，提高育种效率。本发明利用SLAF-seq技术开发大量的梅花垂枝的SNP标记，筛选紧密连锁的分子标记，为其分子标记辅助选择育种提供重要基础。

发明内容

为解决现有技术中存在的梅花垂枝性状筛选周期长、效率低等问题，本发明的目的是提供梅花垂枝性状SNP分子标记及其应用。

为了实现本发明目的，本发明是以‘六瓣’梅为母本，‘粉台垂枝’为父本杂交获得的F₁分离群体、直枝和垂枝梅花品种为试材，开展梅花垂枝性状分子标记的开发及标记辅助选择育种体系的建立。

本发明提供的梅花垂枝性状SNP分子标记，包括分子标记Marker301243和/或Marker311414，它们的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示。

本发明还提供用于扩增所述分子标记的特异性PCR引物。

标记Marker301243引物序列为：

正向引物：5′-TGAGAATGGACAATGAGCGT-3′

反向引物：5′-CTCTGCTGGACACCCCTAAT-3′

标记Marker311414引物序列为：

正向引物：5′-CTTAGGGAATGGTGTCGCTT-3′

反向引物：5′-AGAGCAGGCACCCAAGTAAGT-3′

本发明还提供所述分子标记在鉴定梅花垂直性状中的应用，包括以下步骤：

1)提取待测梅花的基因组DNA；

2)以待测植株的基因组DNA为模板，利用扩增所述分子标记的引物，进行PCR扩增反应；