[发明专利]一种检测马铃薯卷叶病毒的荧光定量PCR方法在审
申请号: | 201810903536.2 | 申请日: | 2018-08-09 |
公开(公告)号: | CN109097492A | 公开(公告)日: | 2018-12-28 |
发明(设计)人: | 陈兆贵;叶新友;侯红因;邢澍祺;毛露甜;黄雁 | 申请(专利权)人: | 惠州学院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12R1/94 |
代理公司: | 惠州市超越知识产权代理事务所(普通合伙) 44349 | 代理人: | 陈文福;郝丽娜 |
地址: | 516000 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 马铃薯 荧光定量PCR 反转录 卷叶 种检测 病毒 总RNA 检测 实时荧光定量PCR 生物检测技术 马铃薯植株 定量分析 病毒基因 材料消耗 定量检测 分子水平 两对引物 内参基因 特异性强 引物设计 灵敏度 扩增 引物 基因 | ||
1.一种检测马铃薯卷叶病毒的荧光定量PCR方法,其特征在于:包括如下步骤:
(1)RNA提取:提取马铃薯的总RNA;
(2)反转录:将提取的总RNA反转录成cDNA;
(3)引物设计:分别设计用于扩增内参基因和PLRV基因的两对引物;
(4)荧光定量PCR:将反转录的cDNA和设计好的引物配制成PCR反应体系,进行实时荧光定量PCR反应。
2.根据权利要求1所述的一种检测马铃薯卷叶病毒的荧光定量PCR方法,其特征在于:所述步骤(1)与所述步骤(2)之间还包括步骤(1.1)总RNA的纯度检测:使用超微量分光光度计检测总RNA浓度和纯度,检验提取的RNA质量是否合格。
3.根据权利要求2所述的一种检测马铃薯卷叶病毒的荧光定量PCR方法,其特征在于:所述步骤(1.1)与所述步骤(2)之间还包括步骤(1.2)总RNA的完整性检测:采用1.0%琼脂糖凝胶进行电泳检测,用凝胶成像分析系统进行观察,并记录成像。
4.根据权利要求1所述的一种检测马铃薯卷叶病毒的荧光定量PCR方法,其特征在于:所述步骤(3)中,引物包括用于扩增内参基因的引物Actin-F和引物Actin-R、以及用于扩增PLRV基因的引物PLRV2-F和引物PLRV2-R,4条引物的核苷酸序列分别为:
Actin-F:5’-GCTTCCCGATGGTCAAGTCA-3’
Actin-R:5’-GGATTCCAGCTGCTTCCATTC-3’
PLRV2-F:5’-CGCCGAAGACGCAGAAGAGGA-3’
PLRV2-R:5’-AGACTCGGCCCGAAGGTGAA-3’。
5.根据权利要求1所述的一种检测马铃薯卷叶病毒的荧光定量PCR方法,其特征在于:所述步骤(4)中, PCR反应体系以20μL计包括:2×TB Green Premix Ex Taq II 10μL、10 μM PCR Forward Primer 0.8μL、10 μM PCR Reverse Primer 0.8μL、50×ROX ReferenceDye 0.4μL、cDNA模板2μL和灭菌水6μL。
6.根据权利要求1所述的一种检测马铃薯卷叶病毒的荧光定量PCR方法,其特征在于:所述步骤(4)中,PCR扩增的反应条件为:第一阶段:50℃预热保温2min,95℃预变性10min;第二阶段:95℃变性15s,60℃退火延伸1min;第三阶段:95℃变性15min,60℃退火延伸1min,随后以0.05℃/s的升温速度升温到95℃。
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