[发明专利]DNA编码碎片分子库的合成方法和连接基团的筛选方法有效
申请号: | 201811250368.8 | 申请日: | 2018-10-25 |
公开(公告)号: | CN109468310B | 公开(公告)日: | 2020-12-01 |
发明(设计)人: | 熊峰;周海鹏;李笑宇 | 申请(专利权)人: | 深圳劲宇生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C40B50/06;C40B30/04 |
代理公司: | 深圳中一联合知识产权代理有限公司 44414 | 代理人: | 张全文 |
地址: | 518000 广东省深圳市坪山新区*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | dna 编码 碎片 分子 合成 方法 连接 基团 筛选 | ||
1.一种DNA编码碎片分子库的合成方法,其特征在于,提供A链、B链、C链;
所述A链含有n1序列、非编码区NC且所述A链连接有三叉结构基团,所述三叉结构基团的每个叉上具有官能团,每个所述官能团携带有保护基;所述官能团为巯基;所述保护基为叔丁基硫基﹑三苯甲基﹑苯甲酰基;
所述B链含有n2序列,所述n2序列为R2结构基团的标签;
所述C链含有n3序列,所述n3序列为R3结构基团的标签;
采用“分组-合并-分组”的合成方式,获得具有R1、R2和R3结构基团的A5链,且所述n1序列为R1结构基团的标签。
2.如权利要求1所述的DNA编码碎片分子库的合成方法,其特征在于,所述“分组-合并-分组”的合成方式包括以下步骤:
将具有R1结构基团的化合物与A链进行反应,使所述R1结构基团与其中一个所述官能团发生反应,获得具有R1结构基团的A1链;
采用DNA连接酶将A1链与B链连接,获得A2链;
将具有R2结构基团的化合物与A2链进行反应,使所述R2结构基团与其中一个所述官能团发生反应,获得具有R1和R2结构基团的A3链;
采用DNA连接酶将A3链与C链连接,获得A4链;
将具有R3结构基团的化合物与所述A4链反应,使所述R3结构基团与其中剩余的所述官能团发生反应,获得具有R1、R2和R3结构基团的A5链。
3.一种连接基团的筛选方法,其特征在于,包括以下步骤:
提供如权利要求1~2任一项所述的合成方法合成的DNA编码碎片分子库;
提供具有n4序列的D链,所述D链修饰一个具有三叉结构的连接基团L,所述D链的非编码区NCr与所述DNA编码碎片分子库中的非编码区NC的碱基互补;
将所述DNA编码碎片分子库与固载的靶点蛋白进行孵育,洗脱掉与靶点蛋白没有亲和力或者亲和力较弱的DNA编码碎片分子库,获得与靶点蛋白有较强亲和力的DNA编码碎片分子库化合物;
将所述D链与所述与靶点蛋白有较强亲和力的DNA编码碎片分子库化合物混合并孵育,使所述D链非编码区NCr的DNA与所述与靶点蛋白有较强亲和力的DNA编码碎片分子库化合物携带的非编码区NC的DNA耦合,同时所述化合物中的3个碎片分子转移至所述连接基团L上,并向其中加入DNA聚合酶,使所述D链的DNA发生延展,以复制3个碎片分子对应的n1、n2、n3序列,获得具有三个碎片分子和连接基团L且被n1、n2、n3、n4序列编码的双链DNA。
4.如权利要求3所述的连接基团的筛选方法,其特征在于,还包括对所述的双链DNA进行PCR扩增、测序,识别所述靶点蛋白特异结合的碎片组合及连接基团L。
5.如权利要求3所述的连接基团的筛选方法,其特征在于,所述连接基团L的三叉结构为三叉氨基结构。
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