[发明专利]一种医学图像中小器官的分割方法有效
申请号: | 201811359760.6 | 申请日: | 2018-11-15 |
公开(公告)号: | CN109658419B | 公开(公告)日: | 2020-06-19 |
发明(设计)人: | 吴健;冯芮苇;王文哲;宋庆宇;雷璧闻;陈晋泰;陆逸飞;吴福理 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | G06T7/11 | 分类号: | G06T7/11;G06T7/00;G06K9/62 |
代理公司: | 杭州天勤知识产权代理有限公司 33224 | 代理人: | 胡红娟 |
地址: | 310013 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 医学 图像 中小 器官 分割 方法 | ||
1.一种医学图像中小器官的分割方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)获取包含小器官的医学图像数据作为样本数据,经过预处理后标注标签,将标注后的样本数据分成训练集和测试集;
(2)搭建分割模型,所述分割模型包括DRD模块和ESF模块,所述的DRD模块用于实现小器官的目标检测和动态区域选择,所述ESF模块用于实现对动态区域的精细分割和三维特征融合;
所述的DRD模块包括具有压缩功能的卷积块、实现动态区域检测的PMask-RCNN网络和RAmap处理模块;所述DRD模块的运算方法如下:
(2-1-1)将三维图像数据输入具有压缩功能的卷积块进行压缩;
(2-1-2)将压缩后的图像输入PMask-RCNN网络进行目标识别,得到目标在压缩图像上的边界框BBX以及目标在三维图像上的位置对应图RAmap;
(2-1-3)RAmap处理模块结合RAmap和BBX将原三维图像切割得到BBX-C并输出;
所述的ESF模块的运算方法如下:
(2-2-1)将DRD模块输出的BBX-C及其对应标签,从xyz三个方向分别读取二维数据作为输入;
(2-2-2)分别搭建3个2D分割子模型和1个3D分割子模型,对xyz方向的2D数据和通过DRD模块得到的BBX-C数据进行精细分割,得到四组分割结果;
(2-2-3)四组分割结果通过FFN网络进行融合,得到融合结果输出;
(3)使用训练集对分割模型进行训练,根据模型预测结果与标签的重合度对网络的参数进行调节,直至模型收敛;
(4)将需要分割的医学图像输入训练好的模型中,输出最终的分割结果。
2.根据权利要求1所述的医学图像中小器官的分割方法,其特征在于,步骤(1)中,所述的预处理包括图像数据清洗和切割,将无效的图像数据剔除,将有效图像数据处理成相同大小的尺寸。
3.根据权利要求1所述的医学图像中小器官的分割方法,其特征在于,步骤(1)中,所述标注后的样本数据通过k折交叉验证方法分成训练集和测试集,具体过程如下:
(1-1)不重复抽样将样本数据随机分为k份,每份数据样本数量相等或相接近;
(1-2)每一次挑选其中1份作为测试集,剩余k-1份作为训练集用于模型训练,重复k次,制作k组不同的训练集和测试集组。
4.根据权利要求1所述的医学图像中小器官的分割方法,其特征在于,步骤(3)中,所述模型的具体训练过程为:
(3-1)输入一组训练集,经过DRD模块和ESF模块运算后,ESF模块输出融合结果;
(3-2)将融合结果与ESF模块输入图像对应的标签进行对比,运用DSC函数计算当前模型的损失,并回传到DRD模块中,对所述RAmap进行更新;
(3-3)当达到设定的DSC阈值或达到指定迭代次数时,所述ESF模块停止更新,输出结果;
(3-4)使用上述方法依次输入剩余的训练集进行训练,直至模型收敛。
5.根据权利要求4所述的医学图像中小器官的分割方法,其特征在于,每组训练集训练结束后,将该组的测试集输入模型,得到对应的分割结果,并按DRD中的对应位置拼接回原始图像大小,得到模型在测试数据集上的损失DSC;将所有测试集得到的损失值求平均值,作为模型的性能评估,从而寻找最优参数。
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