[发明专利]核酸合成方法在审
申请号: | 201811448177.2 | 申请日: | 2018-11-30 |
公开(公告)号: | CN109402202A | 公开(公告)日: | 2019-03-01 |
发明(设计)人: | 邢伟;梁金金;吕伟莹 | 申请(专利权)人: | 深圳华大生命科学研究院 |
主分类号: | C12P19/34 | 分类号: | C12P19/34;C12M1/40;C12M1/00 |
代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 | 代理人: | 李程达 |
地址: | 518083 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 核酸合成 浸泡式 起始核酸分子 固体支持物 反应试剂 洗涤试剂 终止试剂 浸泡 切除 | ||
1.一种使用浸泡式反应方案进行核酸合成的方法,包括以下步骤:
a.提供其上固定有起始核酸分子的固体支持物,
b.将所述固体支持物浸泡在含有反应试剂TdT-dNTP的第一反应容器中,使所述起始核酸分子与TdT-dNTP充分反应,生成第一延伸产物;
c.将固体支持物浸泡在置于第二反应容器中的终止试剂中,以终止反应;
d.将固体支持物浸泡在置于第三反应容器中的切除试剂中,或将固体支持物暴露于光,以从第一延伸产物上切除TdT;
e.将固体支持物浸泡在置于第四反应容器中的洗涤试剂中进行洗涤、纯化得到延伸后的核酸分子;
f.任选地,重复步骤b至e。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述反应试剂TdT-dNTP选自TdT-dATP、TdT-dTTP、TdT-dCTP、TdT-dGTP、TdT-dUTP中的任一种,根据意欲合成的核酸分子的序列,在步骤b中将所述固体支持物浸泡在含有相应反应试剂TdT-dNTP的反应容器中。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其中所述步骤b至e重复一次或多次,例如重复1、2、3、4、5、10、15、20、30、40、50、60、70、80、90、100或更多次。
4.根据权利要求1-3任一项所述的方法,还包括:在合成完成后从合成的核酸分子中除去所述起始核酸分子。
5.根据权利要求1-4任一项所述的方法,其中所述反应试剂TdT-dNTP含有光可切割的接头,在步骤d中将固体支持物暴露于切除试剂后,TdT被切除。
6.根据权利要求1-4任一项所述的方法,其中所述反应试剂TdT-dNTP含有化学可切割的接头,在步骤d中将固体支持物暴露于光后,TdT被切除。
7.根据权利要求1-6任一项所述的方法,其中,所述反应容器具有选自下列的一个或多个特征:
(a)所述反应容器为能够容纳试剂的装置或容器,例如槽、渠、孔、试管、杯、皿;
(b)所述反应容器具有期望的形状,例如方形、球形、锥形、圆柱体形、不规则形状、或其任何组合;
(c)所述反应容器具有期望的尺寸,例如能够容纳至少1μL、至少2μL、至少5μL、至少10μL、至少20μL、至少50μL、至少100μL、至少200μL、至少500μL、至少1mL、至少2mL、至少5mL、至少10mL、至少20mL、至少50mL、至少100mL、至少200mL、至少500mL、至少1L或更多的溶液;
(d)所述反应容器由不会不利地影响反应试剂的活性的材料制成,例如由玻璃、金属诸如不锈钢、聚合材料如塑料等制成;和
(e)所述反应容器是一端开口的。
8.根据权利要求1-7任一项所述的方法,其中,所述固体支持物具有选自下列的一个或多个特征:
(a)所述固体支持物由惰性材料制成;优选地,所述固体支持物由选自下列的材料制成:玻璃、陶瓷、金属(例如金颗粒)、硅片(硅晶)、聚四氟乙烯、乳胶、葡聚糖、聚苯乙烯(修饰或未经修饰的,例如聚乙二醇包覆的聚苯乙烯)、聚丙烯、聚酰胺(例如聚丙烯酰胺,聚二甲基丙烯酰胺)、聚乙二醇,或其任何组合;
(b)所述固体支持物具有期望的形状,例如片状,棱柱体形(例如长方体)、球形、锥体形、圆柱体形、不规则形状、或其任何组合;和
(c)所述固体支持物的表面为平面的或多孔的。
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