[发明专利]用于核酸测序的系统和方法

权利要求书

1.一种用于检测核酸分子的方法，其包括：

(a)提供与传感器阵列相邻的多个双链核酸分子，其中所述多个核酸分子中的给定双链核酸分子与所述传感器阵列中的给定传感器相邻放置，其中所述给定双链核酸分子包含第一单链核酸分子和与所述第一单链核酸分子具有序列互补性的第二单链核酸分子，并且其中所述给定传感器电偶联至包含所述给定双链核酸分子的电荷双层；

(b)使所述第二单链核酸分子的至少一部分经历从所述第一单链核酸分子的释放，以提供所述第一单链核酸分子的不与所述第二单链核酸分子杂交的区段；

(c)使所述区段与个体核苷酸接触，以使所述区段经历从所述个体核苷酸生成第三单链核酸分子的核酸掺入反应，其中所述第三单链核酸分子与所述第一单链核酸分子具有序列互补性；以及

(d)在进行所述核酸掺入反应期间或之后，使用所述给定传感器检测指示所述个体核苷酸掺入所述第三单链核酸分子的信号，从而确定所述区段的序列或长度。

2.根据权利要求1所述的方法，其中释放所述第二单链核酸分子的所述至少一部分形成侧翼，并且其中从所述第二单链核酸分子切割所述侧翼。

3.根据权利要求2所述的方法，其中在检测指示所述个体核苷酸的掺入的所述信号后切割所述侧翼。

4.根据权利要求1所述的方法，其中所述第二单链核酸分子选自核酸亚单位文库。

5.根据权利要求4所述的方法，其中所述核酸亚单位文库包含随机序列。

6.根据权利要求4所述的方法，其中所述核酸亚单位文库中的给定核酸亚单位包含至少五个核苷酸。

7.根据权利要求4所述的方法，其中所述核酸亚单位文库包含肽核酸或锁核酸。

8.根据权利要求1-7中任一项所述的方法，其中所述第二单链核酸分子包含一个或多个可检测标记。

9.根据权利要求8所述的方法，其中从所述第一单链核酸分子释放所述第二单链核酸分子或其部分生成指示所述个体核苷酸掺入所述第三单链核酸分子的所述信号。

10.根据权利要求1-9中任一项所述的方法，其中所述多个双链核酸分子偶联至多个珠子，其中所述给定双链核酸分子偶联至所述多个珠子中的给定珠子，并且其中所述电荷双层与所述给定珠子的表面相邻。

11.根据权利要求1-9中任一项所述的方法，其中所述多个双链核酸分子偶联至所述传感器阵列的一个或多个表面，其中所述给定双链核酸分子偶联至所述给定传感器的表面，并且其中所述电荷双层与所述表面相邻。

12.根据权利要求1-11中任一项所述的方法，其中(c)进一步包括提供与所述区段相邻的引发位点，并在引物从所述引发位点延伸时生成所述第三单链核酸分子。

13.根据权利要求1-12中任一项所述的方法，其中所述给定传感器包含至少两个电极。

14.根据权利要求1-13中任一项所述的方法，其中所述个体核苷酸的至少一个子集包含阻止另外的核苷酸与所述第一单链核酸分子稳定杂交的可逆终止子。

15.根据权利要求14所述的方法，其中在所述个体核苷酸掺入所述第三单链核酸分子之后并且在另一个个体核苷酸掺入所述第三单链核酸分子之前移除所述可逆终止子。

16.根据权利要求1-15中任一项所述的方法，其中所述个体核苷酸的至少一个子集包含可检测标记。

17.根据权利要求16所述的方法，其中所述可检测标记是静电部分。