[发明专利]基于Hi-C和脂质体筛选乙肝治疗剂的方法

权利要求书

1.一种用于在患病对象中筛选乙肝治疗剂功效的方法，其包括以下步骤：(a)确定HBV基因的整合信息；(b)向所述对象施用用于筛选乙肝治疗剂的组合物；(c)获得包括来自所述对象的肝细胞的样品；(d)通过独特的条码识别包括多种类型的载体的肝细胞中所述至少一种治疗剂的功效；和(e)分析所述HBV基因的整合信息和所述至少一种治疗剂的功效之间的相关性；由此在患病对象中根据HBV基因的整合信息筛选乙肝治疗剂功效。

2.权利要求1的方法，其中，确定HBV基因的整合信息的方法包括：

从感染HBV的肝细胞中提取至少一条染色质，所述至少一个染色质包含第一区域和第二区域，所述第一区域包含HBV核苷酸片段；

检测所述第一区域和所述第二区域之间的交互频率；和

基于所述交互频率，分析HBV基因在肝细胞基因组中的整合信息。

3.权利要求2的方法，其中，所述肝细胞是人肝细胞。

4.权利要求2或3的方法，其中，所述第一区域和第二区域位于同一染色质。

5.权利要求2或3的方法，其中，所述第一区域和第二区域位于不同染色质。

6.权利要求1至5中任一项所述的方法，其中，所述整合信息包括HBV核苷酸片段的序列。

7.权利要求1至6中任一项所述的方法，其中，所述整合信息包括与HBV核苷酸片段交互频率高于规定值的至少一个肝细胞核苷酸序列。

8.权利要求1至7中任一项所述的方法，其中，所述整合信息包括与HBV核苷酸片段交互频率最高的肝细胞核苷酸序列。

9.权利要求1至8中任一项所述的方法，其中，所述HBV是选自A型、B型、C型、D型、E型、F型、G型、H型中的任一种HBV亚型。

10.权利要求1至9中任一项所述的方法，其中，用于筛选乙肝治疗剂的组合物包括至少一种载体，所述至少一种载体包括：(a)单细胞治疗有效量的至少一种待筛选乙肝治疗剂；(b)独特地识别所述至少一种乙肝治疗剂的一个或多个核酸条码；和(c)任选的标记。

11.权利要求10所述的方法，其中所述治疗有效量足以用于调节单细胞的状态，所述状态是指受感染肝细胞的增殖、分化、衰老或凋亡等细胞活动的状态，以及受感染肝细胞内乙肝病毒的功能或活性。

12.权利要求11所述的方法，其中评价所述乙肝病毒的功能或活性包括以下指标：HBVDNA、HBV RNA、HBeAg、HBsAg、cccDNA等。

13.权利要求10至12中任一项所述的方法，其中，所述组合物进一步包括不含乙肝治疗剂的至少一种对照载体，并且包括独特地识别所述对照载体的一个或多个核酸条码。

14.权利要求10至13中任一项所述的方法，其中所述核酸条码的长度为5-400个核苷酸。

15.权利要求14所述的方法，其中所述核酸条码包括与所述细胞的核酸基本上不一致或互补的序列。

16.权利要求10至15中任一项所述的方法，其中所述至少一种载体为脂质基颗粒。

17.权利要求16所述的方法，其中所述至少一种载体为脂质体。

18.权利要求10至17中任一项所述的方法，其中所述标记选自：荧光团、发色团、化学发光分子、磁性颗粒、染料、金属、稀土金属、金属和放射性同位素。