[发明专利]用于欧鳇和闪光鲟物种鉴定的SSR引物对组、试剂盒、鉴定方法及应用有效
| 申请号： | 201911168829.1 | 申请日： | 2019-11-25 |
| 公开（公告）号： | CN110846419B | 公开（公告）日： | 2023-05-26 |
| 发明（设计）人： | 张书环;杜浩;张辉;阮瑞;危起伟 | 申请（专利权）人： | 中国水产科学研究院长江水产研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司： | 深圳泛航知识产权代理事务所(普通合伙) 44867 | 代理人： | 邓爱军 |
| 地址： | 430070 湖北省武汉市*** | 国省代码： | 湖北;42 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 用于 闪光 物种 鉴定 ssr 引物 试剂盒 方法 应用 | ||
1.一种用于欧鳇和闪光鲟物种鉴定的SSR引物对组，其特征在于，包括正向引物P3-89F和反向引物P3-89R，其中正向引物P3-89F具有如SEQ ID NO.1所示核苷酸序列，反向引物P3-89R具有如SEQ ID NO.2所示核苷酸序列；
SEQ ID NO.1所示核苷酸序列为AGCCACCACTGCAAAACAG；
SEQ ID NO.2所示核苷酸序列为GCTTCCAGGAAACAGTGGAA。
2.如权利要求1所述的SSR引物对组，其特征在于，所述正向引物P3-89F可用荧光染料进行标记。
3.一种用于欧鳇和闪光鲟物种鉴定的试剂盒，其特征在于，包括权利要求1所述的SSR引物对组。
4.如权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括：水、PCR缓冲液、dNTPs、DNA聚合酶、上样缓冲液中的一种或多种。
5.一种欧鳇和闪光鲟间的物种鉴定方法，其特征在于，包括如下步骤：
S1、提取待鉴定的欧鳇和闪光鲟的DNA样本；
S2、合成如权利要求1所述的SSR引物对组，且利用所述SSR引物对组、以步骤S1中获取的DNA样本为模板进行PCR扩增；
S3、对经步骤S2获得的PCR扩增产物进行检测，以获得PCR扩增产物多态性原始数据；
以及S4、对PCR扩增产物多态性原始数据进行分析，以得出测序峰图数据，并根据所述测序峰图数据对欧鳇和闪光鲟进行鉴定。
6.如权利要求5所述的鉴定方法，其特征在于，在进行PCR扩增时，所述正向引物P3-89F的退火温度为50～60℃；所述反向引物P3-89R的退火温度为50～58℃。
7.如权利要求6所述的鉴定方法，其特征在于，在进行PCR扩增时，所述正向引物P3-89F与反向引物P3-89R的退火温度均为52℃。
8.如权利要求1所述的SSR引物对组和/或如权利要求3所述的试剂盒和/或如权利要求5中所述的鉴定方法在欧鳇和闪光鲟的种间鉴定/种质鉴定/家系管理中应用。
9.一种分离的SSR标志物，其特征在于，其通过权利要求1所述的SSR引物对组、以欧鳇的DNA样本为模板扩增获得。
10.如权利要求9所述的SSR标记物，其特征在于，所述SSR标志物包括1个微卫星核心序列TAG。
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