[发明专利]一种肿瘤自动分割系统、方法及电子设备在审
申请号: | 201911181162.9 | 申请日: | 2019-11-27 |
公开(公告)号: | CN111028242A | 公开(公告)日: | 2020-04-17 |
发明(设计)人: | 贾富仓;刘宇白 | 申请(专利权)人: | 中国科学院深圳先进技术研究院 |
主分类号: | G06T7/11 | 分类号: | G06T7/11;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 深圳市科进知识产权代理事务所(普通合伙) 44316 | 代理人: | 曹卫良 |
地址: | 518055 广东省深圳*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 肿瘤 自动 分割 系统 方法 电子设备 | ||
1.一种肿瘤自动分割方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤a:获取肿瘤部位的原始图像;
步骤b:对所述原始图像进行剪裁处理,保留图像的非零区域,分析图像并获取间距、强度分布和形状数据;
步骤c:结合U-Net网络、注意力机制及双阶段级联架构构建MILU-Net网络模型,所述MILU-Net网络模型包括最小化信息损失模块、注意力机制模块和双阶段级联架构模块;
步骤d:将所述间距、强度分布和形状数据输入MILU-Net网络模型,得到肿瘤分割结果。
2.根据权利要求1所述的肿瘤自动分割方法,其特征在于,在所述步骤c中,所述MILU-Net网络模型包括卷积层、修正线性单元、池化层、dropout层、上采样层;所述MILU-Net网络呈U形对称结构,分为编码-解码两个阶段;所述编码阶段是特征提取部分,为U型结构的左侧部分,所述编码阶段融入了多尺度输入机制的最小化信息损失模块,所述最小化信息损失模块通过空洞卷积获取图像中的信息;所述解码阶段是特征复原部分,为U型结构的右侧部分,所述解码阶段融合了注意力机制模块,所述注意力机制模块用于抑制图像中的不相关区域。
3.根据权利要求2所述的肿瘤自动分割方法,其特征在于,所述最小化信息损失模块应用在下采样阶段,其包括空洞卷积层、卷积层、修正线性单元、归一化层;所述编码阶段的特征提取方式具体为:所述图像经过空洞卷积层获取全局信息,将分辨率变为与同级层图像相同的分辨率,再由三个block将上层传入的特征图与最小化信息损失模块获取的信息相加,然后由两个连续的3x3的卷积层进行特征提取操作,再由一个3x3的最大池化进行下采样操作,且以所述图像特征通道数30开始,每进行一次下采样操作后,图像的特征通道数都进行加倍。
4.根据权利要求3所述的肿瘤自动分割方法,其特征在于,所述解码阶段包括4个block+1个概率输出层,所述四个block分别由一个上采样层和两个3x3卷积组成;所述解码阶段的特征复原方式具体为:将编码阶段的信息通过1x1的卷积操作和卷积操作后的信息直接连接到注意力机制模块中,经过所述注意力机制模块计算每个像素的重要系数,再与原始信息的对应点相乘使网络将注意力聚集在肿瘤部分,且每进行一次反卷积上采样时,图像特征通道数减半,最后通过1x1的sigmoid层输出每个像素所属的概率图。
5.根据权利要求1至4所述的肿瘤自动分割方法,其特征在于,所述双阶段级联架构模块包括两部分,第一部分以原始图像作为输入,包括全分辨率的肿瘤二值金标准和原始图像,第二部分以第一部分输出的二值预测分割结果图为基础,进行裁剪操作,去除肿瘤以外的无关部分,并重新输入到训练网络中,输出的结果再按照原位置插回到原始图像中,得到最终的肿瘤分割结果。
6.一种肿瘤自动分割系统,其特征在于,包括:
图像获取模块:用于获取肿瘤部位的原始图像;
图像处理模块:用于对所述原始图像进行剪裁处理,保留图像的非零区域,分析图像并获取间距、强度分布和形状数据;
网络构建模块:用于结合U-Net网络、注意力机制及双阶段级联架构构建MILU-Net网络模型,所述MILU-Net网络模型包括最小化信息损失模块、注意力机制模块和双阶段级联架构模块;
结果输出模块:用于将所述间距、强度分布和形状数据输入MILU-Net网络模型,得到肿瘤分割结果。
7.根据权利要求6所述的肿瘤自动分割系统,其特征在于,所述MILU-Net网络模型包括卷积层、修正线性单元、池化层、dropout层、上采样层;所述MILU-Net网络呈U形对称结构,分为编码-解码两个阶段;所述编码阶段是特征提取部分,为U型结构的左侧部分,所述编码阶段融入了多尺度输入机制的最小化信息损失模块,所述最小化信息损失模块通过空洞卷积获取图像中的信息;所述解码阶段是特征复原部分,为U型结构的右侧部分,所述解码阶段融合了注意力机制模块,所述注意力机制模块用于抑制图像中的不相关区域。
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