[发明专利]用于检测肾纤维化的组合物和方法

说明书

公开了用于检测与肾纤维化相关的蛋白质的组合物和方法.此类生物标志物可用于允许易患肾纤维化的个体管理其生活方式并减少疾病的进一步进展。

相关申请

本申请要求2018年5月11日提交的美国临时专利申请号62/670,344的优先权。美国临时专利申请号62/670,344的公开内容通过引用整体并入本文。

技术领域

本公开内容涉及用于诊断肾纤维化的方法和组合物。

背景技术

肾纤维化背后的生物学机制在很大程度上尚不清楚，并且很少(如果有的话)有提供这种病况的可靠指示的生物标志物。对易患肾纤维化的个体有帮助的是调整其生活方式以避免触发症状的发作和/或避免促进疾病的进一步进展。因此，需要开发和评估肾纤维化的生物标志物。

发明内容

本公开内容可以以各种方式来体现。

在一个实施方案中，公开了一种检测个体中与肾纤维化相关的生物标志物的方法，所述方法包括以下步骤：从所述个体获得生物样品；和测量生物样品中所述生物标志物的量和/或编码所述生物标志物或调节所述生物标志物的表达的核酸(例如，基因组DNA或mRNA)的量或突变。在一个实施方案中，生物标志物包括以下中的至少一种：皮质酮、醛固酮、ADAM金属肽酶结构域17(ADAM17)、C-C基序趋化因子配体2(CCL2)、钙粘蛋白1(CDH1)、结缔组织生长因子(CTGF)、表皮生长因子受体(EGFR)、纤连蛋白1(FN1)、半乳凝素-1(LGALS1)、半乳凝素-3(LGAS3)、肝细胞生长因子(HGF)、细胞间粘附分子1(ICAM1)、白细胞介素1β(IL1B)、白细胞介素6(IL6)、Kruppel样因子15(KLF15)、基质金属肽酶2(MMP2)、基质金属肽酶7(MMP7)、基质金属肽酶9(MMP9)、核因子κB亚基1(NFKB1)、肾病蛋白(nephrin)(NPHS1)、podicin(NPHS2)、核受体亚家族3C组成员2(NR3C2)、丝氨酸蛋白酶抑制剂(serpin)E家族成员1(SERPINE1)、SMAD家族成员2(SMAD2)、SMAD家族成员3(SMAD3)、SMAD家族成员4(SMAD4)、SMAD家族成员7(SMAD7)、信号转导与转录激活因子3(STAT3)、转化生长因子β1(TGFB1)、尿调节素(UMOD)或血管内皮生长因子A(VEGFA)。在某些实施方案中，生物标志物包括转化生长因子β1(TGFB1)、金属肽酶2(MMP2)、尿调节素(UMOD)、SMAD家族成员2(SMAD2)、SMAD家族成员7(SMAD7)、结缔组织生长因子(CTGF)或C-C基序趋化因子配体2(CCL2)中的至少一种。在某些实施方案中，生物标志物包括转化生长因子β1(TGFB1)、金属肽酶2(MMP2)、尿调节素(UMOD)、SMAD家族成员2(SMAD2)或SMAD家族成员7(SMAD7)中的至少一种。在某些实施方案中，生物标志物包括转化生长因子β1(TGFB1)或金属肽酶2(MMP2)中的至少一种。

另外和/或备选地，所述方法可以包括测量至少一种标准物(例如，管家基因)。或者，可以执行这些生物标志物的各种组合的测量。

在下面的详细描述、附图和权利要求书中，本公开内容的其他特征、目的和优点是明显的。然而，应该理解的是，详细描述、附图和权利要求虽然指示了所公开的方法、组合物和系统的实施方案，但是仅以示例而非限制的方式给出。对于本领域技术人员而言，在本发明范围内的各种改变和修改将变得明显。

附图说明

鉴于以下非限制性附图，可以更好地理解本公开内容。

图1显示了鉴定与肾纤维化相关的生物标志物的多节点相互作用网络的示例。

图2显示了鉴定与肾纤维化相关的生物标志物的多节点相互作用网络的替代示例。

图3显示了通过数据挖掘指示的与肾纤维化相关的生物标志物的示例。