[发明专利]信息处理设备、信息处理方法和程序在审
申请号: | 201980082674.1 | 申请日: | 2019-11-08 |
公开(公告)号: | CN113168529A | 公开(公告)日: | 2021-07-23 |
发明(设计)人: | 山根健治;榎润一郎;村田泠;二村孝治;格雷戈里·韦尔特里 | 申请(专利权)人: | 索尼集团公司 |
主分类号: | G06K9/00 | 分类号: | G06K9/00;G06K9/62 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 吴孟秋 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 信息处理 设备 方法 程序 | ||
提供了一种信息处理设备,包括:信息存储单元,将来自细胞的光的感测结果即第一数据和将第一数据分离成多个荧光的结果即第二数据彼此相关联地存储;聚类单元,基于第二数据将细胞聚类成多个簇;以及输出单元,输出来自聚类单元的聚类结果。输出单元附加地输出与包括在由用户从多个簇当中选择的簇中的细胞有关的第一数据和第二数据中的至少一者或多者。
技术领域
本公开涉及信息处理设备、信息处理方法和程序。
背景技术
本公开涉及信息处理设备、信息处理方法和程序。
在诸如医学和生物化学的领域中,为了快速地测量大量细胞的特性,使用流式细胞仪正变得普遍。流式细胞仪是通过用光照射流过流动室的细胞并且检测从细胞发射的荧光、散射光等来光学地测量细胞的特性的设备。
最近,对于流式细胞仪,一次可以测量的荧光的数目正在增加。利用这种布置,由于测量数据的维度的增加导致组合爆炸发生,因此用流式细胞仪手动分析测量的数据变得困难。
因此,正在通过机器学习聚类分析流式细胞仪测量的多维数据,如El-ad DavidAmir,et al,“viSNE enables visualization of high dimensional single-cell dataand reveals phenotypic heterogeneity of leukemia”,Nature Biotechnology,2013Jun,31(6),545-552中公开。
然而,在每个维度中的噪声量相同的情况下,对于高维度的数据,聚类性能下降。为此,在对流式细胞仪的测量数据进行聚类的情况下,通常通过对测量数据进行荧光分离等来降低维度,并且对维度压缩的数据进行聚类。
现有技术文献
非专利文献
非专利文献1:El-ad David Amir,et al,“viSNE enables visualization ofhigh dimensional single-cell data and reveals phenotypic heterogeneity ofleukemia”,Nature Biotechnology,2013Jun,31(6),545-552
发明内容
然而,在对多维数据执行维度压缩的情况下,在测量数据中包括的信息的一部分由于维度压缩而丢失。为此,例如,在多维数据的聚类结果不适当的情况下,用户难以返回流式细胞仪的测量数据并且验证聚类结果的有效性。
因而,本公开提出了一种新型和改进的信息处理设备、信息处理方法和程序,其能够使用三维压缩的数据对测量数据进行聚类,同时还能够验证返回到测量数据的聚类结果。
据本公开的实施方式,提供了一种信息处理设备,包括:信息存储单元,将来自细胞的光的感测结果即第一数据和将第一数据分离成多个荧光的结果即第二数据彼此相关联地存储;聚类单元,基于第二数据将细胞聚类成多个簇;以及输出单元,输出来自聚类单元的聚类结果。输出单元附加地输出与包括在由用户从多个簇当中选择的簇中的细胞有关的第一数据和第二数据中的至少一者或多者。
此外,根据本公开的实施方式,提供了一种信息处理方法,包括:将来自细胞的光的感测结果即第一数据和将第一数据分离成多个荧光的结果即第二数据彼此相关联地存储;基于第二数据将细胞聚类成多个簇;以及输出来自聚类单元的聚类结果;以及附加地输出与包括在由用户从多个簇当中选择的簇中的细胞有关的第一数据和第二数据中的至少一者或多者。
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