[发明专利]一种区分曼地亚红豆杉不同品种的方法有效
申请号: | 202010691679.9 | 申请日: | 2020-07-17 |
公开(公告)号: | CN111607665B | 公开(公告)日: | 2022-10-18 |
发明(设计)人: | 章铖超;黄洁芳;沈晨佳;王慧中 | 申请(专利权)人: | 杭州师范大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12Q1/6806;C12N15/11;G16B20/20 |
代理公司: | 杭州君度专利代理事务所(特殊普通合伙) 33240 | 代理人: | 朱亚冠 |
地址: | 311121 浙江省杭*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 区分 红豆杉 不同 品种 方法 | ||
1.一种根据转录组测序数据开发的曼地亚红豆杉SSR引物对组,其特征在于包括MDY61、MDY100、MDY101、MDY125、MDY328和MDY416;
2.一种区分不同品种曼地亚红豆杉的方法,其特征在于包括以下步骤:
步骤(1)、采取改良CTAB方法对曼地亚红豆杉的基因组DNA进行提取,具体如下:
1-1:将曼地亚红豆杉叶片置于研钵中,用液氮研磨至粉末;
1-2:将100mg粉末加入600μL 2×CTAB试剂,轻轻摇动混匀;
1-3:置于65℃水浴槽中,每隔10min轻轻摇动,40min后取出;
1-4:常温冷却1min后加入600μL氯仿剧烈振荡混匀;
1-5:12000rpm离心5min;
1-6:取400μL上清液加入上述上清液3/4体积的异丙醇,缓慢颠倒混匀,出现的白色絮状沉淀物即为基因组DNA;
1-7:12000rpm离心5min,去上清;
1-8:加入300μL 75%乙醇轻轻洗涤管壁;
1-9:12000rpm离心2min,去上清;
1-10:倒立置于铺开的纸巾上,风干去乙醇;
1-11:用20μL双蒸水溶解沉淀的DNA,1%琼脂糖检测,余下的保存于-20℃;
步骤(2)、SSR-PCR体系
总反应体积为20μL,具体包括10μL 2×Taq Plus PCR MasterMix,权要求利1所述SSR引物对组的上、下游引物各0.5μL,1μL 50ng/μL模板DNA,8μL的ddH2O;
SSR-PCR条件如下:94℃预变性5min;32个循环,其中每个循环包括94℃变性30s,不同引物Tm值复性30s,72℃延伸1min;最后72℃延伸10min;
(3)电泳检测
采用非变性聚丙烯酰胺凝胶垂直电泳对步骤二获得PCR产物进行电泳检测,通过区分度较好的SSR引物进行综合分析。
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