[发明专利]一种区分曼地亚红豆杉不同品种的方法有效

专利信息
申请号: 202010691679.9 申请日: 2020-07-17
公开(公告)号: CN111607665B 公开(公告)日: 2022-10-18
发明(设计)人: 章铖超;黄洁芳;沈晨佳;王慧中 申请(专利权)人: 杭州师范大学
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12Q1/6806;C12N15/11;G16B20/20
代理公司: 杭州君度专利代理事务所(特殊普通合伙) 33240 代理人: 朱亚冠
地址: 311121 浙江省杭*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 一种 区分 红豆杉 不同 品种 方法
【权利要求书】:

1.一种根据转录组测序数据开发的曼地亚红豆杉SSR引物对组,其特征在于包括MDY61、MDY100、MDY101、MDY125、MDY328和MDY416;

2.一种区分不同品种曼地亚红豆杉的方法,其特征在于包括以下步骤:

步骤(1)、采取改良CTAB方法对曼地亚红豆杉的基因组DNA进行提取,具体如下:

1-1:将曼地亚红豆杉叶片置于研钵中,用液氮研磨至粉末;

1-2:将100mg粉末加入600μL 2×CTAB试剂,轻轻摇动混匀;

1-3:置于65℃水浴槽中,每隔10min轻轻摇动,40min后取出;

1-4:常温冷却1min后加入600μL氯仿剧烈振荡混匀;

1-5:12000rpm离心5min;

1-6:取400μL上清液加入上述上清液3/4体积的异丙醇,缓慢颠倒混匀,出现的白色絮状沉淀物即为基因组DNA;

1-7:12000rpm离心5min,去上清;

1-8:加入300μL 75%乙醇轻轻洗涤管壁;

1-9:12000rpm离心2min,去上清;

1-10:倒立置于铺开的纸巾上,风干去乙醇;

1-11:用20μL双蒸水溶解沉淀的DNA,1%琼脂糖检测,余下的保存于-20℃;

步骤(2)、SSR-PCR体系

总反应体积为20μL,具体包括10μL 2×Taq Plus PCR MasterMix,权要求利1所述SSR引物对组的上、下游引物各0.5μL,1μL 50ng/μL模板DNA,8μL的ddH2O;

SSR-PCR条件如下:94℃预变性5min;32个循环,其中每个循环包括94℃变性30s,不同引物Tm值复性30s,72℃延伸1min;最后72℃延伸10min;

(3)电泳检测

采用非变性聚丙烯酰胺凝胶垂直电泳对步骤二获得PCR产物进行电泳检测,通过区分度较好的SSR引物进行综合分析。

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