[发明专利]MCM3相关乳腺癌生物标志物试剂盒、诊断系统及其相关应用在审
申请号: | 202010927463.8 | 申请日: | 2020-09-07 |
公开(公告)号: | CN114150059A | 公开(公告)日: | 2022-03-08 |
发明(设计)人: | 陈居明;朱孝轩;朱莉娜 | 申请(专利权)人: | 香港城市大学深圳研究院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11;G16B5/00;G16B40/00 |
代理公司: | 北京三友知识产权代理有限公司 11127 | 代理人: | 贾磊;周达 |
地址: | 518057 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | mcm3 相关 乳腺癌 生物 标志 试剂盒 诊断 系统 及其 应用 | ||
1.检测以下基因的试剂在制备鉴别乳腺癌细胞和/或诊断乳腺癌的检测系统中的应用:
检测的14个基因包括:TACC3、SPAG5、UBE2T、TNNT1、COMP、MFAP2、GPR68、PKMYT1、MMP13、CRABP2、RAB26、CTXN1、HIST1H2BC和SLC12A8。
2.根据权利要求1所述的应用,其中,检测所述基因的试剂包括采用RT-qPCR技术或微阵列microarray技术用到的材料和/或设备。
3.根据权利要求1所述的应用,其中是对来自待测个体的离体样本进行检测。
4.根据权利要求1所述的应用,其中,将所述14个基因的表达值数据同时输入检测模型中,获得预测的分类结果。
5.一种乳腺癌检测试剂盒,其特征在于,该试剂盒包括:
检测TACC3、SPAG5、UBE2T、TNNT1、COMP、MFAP2、GPR68、PKMYT1、MMP13、CRABP2、RAB26、CTXN1、HIST1H2BC和SLC12A8的基因表达值的试剂材料和/或仪器设备。
6.一种乳腺癌诊断系统,其包括检测单元和数据分析单元,其中:所述检测单元用于检测来自待测个体的离体样本中以下基因表达值,获得检测结果:TACC3、SPAG5、UBE2T、TNNT1、COMP、MFAP2、GPR68、PKMYT1、MMP13、CRABP2、RAB26、CTXN1、HIST1H2BC和SLC12A8;
所述数据分析单元用于对检测单元的检测结果进行分析处理。
7.根据权利要求6所述的乳腺癌诊断系统,其中,所述数据分析单元进一步将所述基因表达值配以权重系数,以计算所述离体样本的风险得分。
8.根据权利要求7所述的乳腺癌诊断系统,其特征在于,所述数据分析单元进一步包括,
预处理模块,用于将所述离体样本的基因表达值标准化;
计算模块,用于将标准化的基因表达值带入到以下检测模型,得到该离体样本的风险得分:
所述风险得分=8.2178595+0.0000001×TACC3+0.1630247×SPAG5+1.1824652×UBE2T+0.8529433×TNNT1+1.2709300×COMP+0.4809236×MFAP2+0.7679371×GPR68+0.5655680×PKMYT1+0.5373511×MMP13-0.5447167×CRABP2+1.4946474×RAB26+0.5254629×CTXN1+0.5588773×HIST1H2BC+1.0419111×SLC12A8。
9.根据权利要求8所述的乳腺癌诊断系统,其特征在于,所述数据分析单元还包括,
矩阵输入模块,用于接收所述预处理模块输出的多个所述标准化的基因表达值,将所述标准化的基因表达值以矩阵形式输入到所述计算模块。
10.根据权利要求8所述的乳腺癌诊断系统,其特征在于,所述数据分析单元还包括,
输出模块,用于接收所述计算模块输出的风险得分,将大于0和小于0的风险得分转换为诊断分类结果。
11.一种计算机存储介质,所述计算机存储介质存储有计算机程序指令,所述计算机程序指令被执行时实现:基于待测个体的TACC3、SPAG5、UBE2T、TNNT1、COMP、MFAP2、GPR68、PKMYT1、MMP13、CRABP2、RAB26、CTXN1、HIST1H2BC和SLC12A8基因的表达水平值获得个体罹患乳腺癌的诊断分类结果。
12.一种计算机设备,包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序,其特征在于,所述处理器执行所述计算机程序时实现:基于待测个体的TACC3、SPAG5、UBE2T、TNNT1、COMP、MFAP2、GPR68、PKMYT1、MMP13、CRABP2、RAB26、CTXN1、HIST1H2BC和SLC12A8基因的表达水平值获得个体罹患乳腺癌的诊断分类结果。
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