[发明专利]监测基因疗法

权利要求书

1.一种监测基因疗法的方法，所述方法包括以下步骤：

在来自已接受整合基因疗法治疗的受试者的生物样品中，作为所述基因疗法治疗状态的一种或多种特性的替代物，检测通过整合所述整合基因疗法治疗而产生的生物标记物的水平或活性，其中所述基因疗法治疗状态的一种或多种特性选自由有效负载的水平、有效负载的活性、所述基因疗法治疗在细胞群中的整合水平及其组合组成的组。

2.一种在已接受递送有效负载的基因整合组合物的受试者中监测所述有效负载的递送、水平和/或活性的方法，所述方法包括以下步骤：

在来自所述受试者的生物样品中，作为所述有效负载的递送、水平和/或活性的替代物，检测通过整合所述基因整合组合物而产生的生物标记物的水平或活性。

3.如权利要求1或权利要求2所述的方法，其中所述有效负载是或包括细胞内表达的肽。

4.如权利要求1或权利要求2所述的方法，其中所述有效负载是或包括细胞外分泌的肽。

5.如权利要求1至4中任一项所述的方法，其中所述有效负载是或包括具有促进治疗医学疾患的生物过程的细胞内在或细胞外在活性的肽。

6.如权利要求1至5中任一项所述的方法，其中所述有效负载是或包括在肝细胞中正常表达的肽。

7.如权利要求1至5中任一项所述的方法，其中所述有效负载是或包括在肝细胞中异位表达的肽。

8.如权利要求1至5中任一项所述的方法，其中所述有效负载是或包括甲基丙二酰基-CoA变位酶或人因子IX。

9.如以上权利要求中任一项所述的方法，其中所述整合基因疗法治疗或基因整合组合物实现将包含编码所述有效负载的序列的核酸元件整合到所述受试者的基因组中的靶位点中。

10.如权利要求9所述的方法，其中所述靶位点编码多肽。

11.如权利要求10所述的方法，其中所述核酸元件的整合发生在编码所述多肽的基因的5'或3'端。

12.如权利要求9所述的方法，其中所述靶位点编码白蛋白。

13.如权利要求9至11中任一项所述的方法，其中所述核酸元件的整合不显著破坏在所述靶位点编码的多肽的表达。

14.如以上权利要求中任一项所述的方法，其中所述生物样品是或包括毛发、皮肤、粪便、血液、血浆、血清、脑脊液、尿液、唾液、眼泪、玻璃体液或粘液。

15.如以上权利要求中任一项所述的方法，其中所述检测步骤包括免疫学测定或核酸扩增测定。

16.如以上权利要求中任一项所述的方法，其中所述生物标记物包括可检测部分，所述可检测部分在由所述靶位点编码的多肽翻译后变成融合到由所述靶位点编码的多肽。

17.如以上权利要求中任一项所述的方法，其中所述生物标记物包括可检测部分，所述可检测部分在由所述靶位点编码的多肽翻译后变成融合到由所述有效负载编码的多肽。

18.如以上权利要求中任一项所述的方法，其中所述生物标记物包含可检测部分，所述可检测部分为2A肽或弗林蛋白酶切割基序。

19.如权利要求18所述的方法，其中所述2A肽选自由P2A、T2A、E2A以及F2A组成的组。

20.如以上权利要求中任一项所述的方法，其中所述受试者接受单剂量的所述基因疗法治疗或基因整合组合物。