[发明专利]一种基于DNA短链杂交的信息存储方法有效
申请号: | 202110093496.1 | 申请日: | 2021-01-22 |
公开(公告)号: | CN112768003B | 公开(公告)日: | 2022-06-07 |
发明(设计)人: | 成鹏飞;张翼飞;吴磊;张东裔;王海华;刘翟;周向红 | 申请(专利权)人: | 湖南科技大学 |
主分类号: | G16B25/20 | 分类号: | G16B25/20;G16B30/00;G16B50/00 |
代理公司: | 湖南兆弘专利事务所(普通合伙) 43008 | 代理人: | 陈晖;谭武艺 |
地址: | 411201*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 dna 杂交 信息 存储 方法 | ||
本发明提供了一种基于DNA短链杂交的信息存储方法,本发明写入信息时将信息转换为二进制代码,以N位二进制对应一组N条DNA短链的2N种组合状态;根据DNA短链的组合状态,将DNA短链与磁珠或固体表面进行交联反应制备交联链,从而将信息存储在交联的DNA短链组合状态中;读取存储信息时,将互补的荧光标记探针与交联的DNA短链杂交,洗涤后,经荧光检测探针的组合状态,得到DNA短链组合,进而转换为N位为一组的二进制代码,将所有的二进制代码按顺序串联组合后,还原为原始存储信息。本发明不依赖于DNA合成技术和DNA测序技术,可以实现信息在DNA媒介的快速存储和读取,准确率高,具有高并行和高通量发展潜力。
技术领域
本发明属于DNA存储技术,具体涉及一种基于DNA短链杂交的信息存储方法。
背景技术
当今世界,信息系统主要建立在电子计算机和互联网的基础上,采用基于电子技术的存储设备来实现的。但是,基于电子技术的存储设备抗打击能力差,信息安全难以保障。传统电子信息存储介质在数据保存时间、存储容量、保存环境等方面均受物理限制。DNA存储技术是生物技术在信息存储领域的全新应用,DNA具有保存时间长、存储信息容量大,且环境适应能力强等优点,是数字信息存储的理想介质,是美国等发达国家竞相研发的热点。
典型的基于DNA合成和测序的信息存储技术,即以碱基作为信息编码单元,将碱基位点的AGCT信息与二进制信息建立一一对应关系,具有抗电磁打击能力强,数据密度高的优势。但该方案虽然信息存储量大,但目前存在读写成本高、时间长等问题,DNA合成与测序耗时较长,成本高,并行性差,距实际应用还有很多技术问题需要解决。
发明内容
本发明要解决的技术问题是:针对上述的不足,本发明提供了一种DNA短链信息存储方法及系统,不需要经过DNA合成与测序,将信息以编码链组合的方式存储,利用荧光标记互补探针与编码链的杂交实现信息读取,本发明通过快速的交联和杂交反应,高度并行,实现了存储信息的快速存取,能够充分发挥生物系统天然优势。
为了解决上述技术问题,本发明是通过以下技术方案实现:
一种基于DNA短链杂交的信息存储方法,包括下述写入信息步骤:
1)将写入信息转换为二进制代码;
2)将二进制代码以N位为一组转换为DNA短链的组合状态,其中N为自然数;
3)根据各组二进制代码的DNA短链的组合状态,将对应的DNA短链与磁珠或固体表面进行交联反应,将DNA短链交联在数据存储微池,从而将写入信息存储在交联的DNA短链组合中。
可选地,步骤1)中将写入信息转换为二进制代码时,写入信息为文本、图片或语音。
可选地,步骤3)中将对应的DNA短链与磁珠或固体表面进行交联反应,将DNA短链交联在数据存储微池的步骤包括:
3.1)在含有化学偶联基团磁珠的数据存储微池或固定有NHS基团的固体表面加入带有末端修饰的DNA短链,和缓冲液,其中化学偶联基团磁珠是指化学偶联有羧基或NHS基团的磁珠;
3.2)控制DNA短链与加入数据存储微池中的化学偶联基团磁珠或固定有NHS基团的固体表面进行交联反应;
3.3)在交联反应完成后进行封闭和洗涤形成交联链,从而完成存储信息的写入。
可选地,步骤3.1)中末端修饰的DNA短链为氨基修饰的DNA短链,且所述氨基修饰DNA短链的长度为16nt或20nt。
可选地,步骤3.1)中加入带有末端修饰的DNA短链时,每10ul化学偶联基团磁珠上交联的末端修饰的DNA短链总量不超过3.2×10-11mol。
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