[发明专利]一种沙鞭微卫星分子标记、引物对及其制备方法与应用

说明书

本发明公开了一种沙鞭微卫星分子标记、引物对及其制备方法与应用，所述微卫星分子标记具有序列表SEQ.ID.No.1‑SEQ.ID.No.13中任意一种或多种的核苷酸序列，对应序列表SEQ.ID.No.1‑SEQ.ID.No.13的微卫星分子标记的特异性引物分别为Pvj1、PVH4、PV14、Pv15、Pv21、Pv33、Pv39、Pv44、Pv49、Pv50、Pv51、Pv8、Pv23；本发明建立了一种制备沙鞭微卫星分子标记的方法，为进行沙鞭种质资源鉴定、遗传多样性分析、植物遗传图谱的构建、种群遗传结构分析、基因定位、数量性状基因的分析、进化与亲缘关系等方面的研究提供分子标记。

技术领域

本发明涉及沙鞭DNA分子标记技术领域，具体涉及一种沙鞭微卫星分子标记、引物对及其制备方法与应用。

背景技术

沙鞭(Psammochloa villosa(Trin.)Bor)是禾本科(Poaceae)、针茅族(stipeae)、沙鞭属(Psammochloa)的一种多年生草本植物，主要分布于我国内蒙古高原及其毗邻沙区，如巴丹吉林沙漠、马兰布和沙漠、腾格里沙漠、库布齐沙漠、毛乌素沙地及甘肃河西走廊沙区、宁夏中北部和陕西北部沙区，是这些极端沙地环境下分布的关键或唯一草本物种，不仅具有重要的生态价值，而且也是我国沙漠地区重要的优势牧草；沙鞭具长而横走的根状茎，圆锥花序紧密直立，小穗具有短柄、淡黄色或白色，外稃密被长柔毛等特征，主要通过克隆繁殖进行后代繁育，具有很强的建群能力，是我国内蒙古沙地及其毗邻地区的先锋植物和建群草本物种；对流动沙丘具有很强的适应性，是沙地植物群聚的优势种，是典型的旱生和沙生植物，对维持这一区域内的生态系统平衡具有不可低估的作用；此外，沙鞭具有较强的耐旱、耐寒、耐碱以及抗病和抗风沙能力，加之花序相对粗长、穗多粒大等优点，是农牧业上禾草良种繁育和牧草利用的重要基因资源；通过开发合理的微卫星分子标记，可为沙鞭开展种质资源遗传多样性、种群结构、种群历史动态等遗传学研究提供有效技术手段，为后续沙鞭资源的合理开发奠定基础；

SSR(simple sequence repeats)即简单重复序列方法，其广泛分布于真核基因组，以特异引物PCR为基础的分子标记技术，通常称之为微卫星DNA(microsatellite DNA)，一般是以1－6个核苷酸为重复单位组成的串联重复序列，如(AC)n、(GA)n、(AT)n、(AAG)n、(AAT)n等，n代表重复次数，从几个到几十个不等，长度一般在100～200bp之间；不同等位基因间的重复数具有高度变异性，这些变异表现为微卫星数目的整倍数变异或重复单位序列中的序列差异，因而SSR具有多态性；SSR标记具有分布广泛、特异性、共显性、操作简单等优势在植物分子标记相关研究中应用广泛；

因此，开发SSR微卫星分子标记，可为开展沙鞭种质资源遗传多样性、种群结构、种群历史动态等遗传学研究提供有效技术手段，而在现有技术中，并没有利用SSR方法对沙鞭进行遗传学方面的相关报道和研究。

发明内容

针对上述存在的问题，本发明旨在提供一种沙鞭微卫星分子标记、引物对及其制备方法与应用，通过利用限制性酶切位点相关的DNA基因组扫描技术开发出沙鞭微卫星分子标记并获得相应的引物，建立了一种制备沙鞭微卫星分子标记的方法，为进行沙鞭种质资源鉴定、遗传多样性分析、植物遗传图谱的构建、种群遗传结构分析、基因定位、数量性状基因的分析、进化与亲缘关系等方面的研究提供分子标记。

为了实现上述目的，本发明所采用的技术方案如下：

一种沙鞭微卫星分子标记，所述微卫星分子标记具有序列表SEQ.ID.No.1-SEQ.ID.No.13中任意一种或多种的核苷酸序列。

一种沙鞭微卫星分子标记的特异性引物，对应序列表SEQ.ID.No.1-SEQ.ID.No.13的微卫星分子标记的特异性引物对应的位点分别编号为Pvj1、PVH4、PV14、Pv15、Pv21、Pv33、Pv39、Pv44、Pv49、Pv50、Pv51、Pv8、Pv23。