[发明专利]一种中药罗汉果在制备防治胶质母细胞瘤产品中的应用在审
申请号: | 202110693038.1 | 申请日: | 2021-06-22 |
公开(公告)号: | CN113332324A | 公开(公告)日: | 2021-09-03 |
发明(设计)人: | 蒋澜;吕坤;童九翠;钟民;杨建课 | 申请(专利权)人: | 皖南医学院第一附属医院(皖南医学院弋矶山医院) |
主分类号: | A61K36/42 | 分类号: | A61K36/42;A61P35/00;G16B15/30;G16H70/40;A61K31/4188 |
代理公司: | 南京业腾知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 32321 | 代理人: | 马静静 |
地址: | 241000*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 中药 罗汉果 制备 防治 胶质 细胞 产品 中的 应用 | ||
1.一种中药罗汉果在制备防治胶质母细胞瘤产品中的应用。
2.一种中药罗汉果在逆转胶质母细胞瘤替莫唑胺耐药性产品中的应用。
3.一种网络药理学探索中药罗汉果治疗胶质母细胞瘤的作用机制的方法,其特征在于,包括:
S1,通过网络数据库筛选中药罗汉果潜在作用于胶质母细胞瘤的化合物和罗汉果靶标DEGs;
S2,罗汉果化合物-靶点-疾病相互作用网络及功能富集分析;
S3,罗汉果化合物和罗汉果靶标DEGs的分子对接和共表达基因的功能富集分析。
4.根据权利要求3所述的网络药理学探索中药罗汉果治疗胶质母细胞瘤的作用机制的方法,其特征在于,S1包括如下步骤:
步骤1、通过PubMed数据库文献分析,获得替莫唑胺治疗胶质母细胞瘤的药物靶标基因;
步骤2、通过TCMSP数据库严格阈值筛选,设定筛选条件,结合TCMID和TCMSP数据库,获得罗汉果中的化合物,根据PubChem数据库得到化合物结构,通过Swiss TargetPrediction和PharmMapper数据库预测罗汉果药物靶标基因,得到罗汉果药物靶基因;
步骤3、通过TTD数据库和PubMed已发表文章的文本数据挖掘,锁定使用替莫唑胺治疗胶质母细胞瘤的药物靶标基因,并与步骤2中得到的罗汉果药物靶基因取交集获得罗汉果相关化合物与替莫唑胺的共同靶标基因;
步骤4、通过PALM-IST挖掘到与胶质母细胞瘤疾病相关的靶基因,与步骤3中罗汉果相关化合物与替莫唑胺的共同靶标基因,取交集得到罗汉果潜在作用于胶质母细胞瘤的靶标基因,并绘制罗汉果相关化合物与胶质母细胞瘤疾病靶标的网络图;设定筛选条件,结合TCGA数据库和GEO数据库,筛选出在GBM和正常脑组织中显著差异表达的罗汉果靶标基因,即罗汉果靶标DEGs。
5.根据权利要求4所述的网络药理学探索中药罗汉果治疗胶质母细胞瘤的作用机制的方法,其特征在于,步骤2中设定的筛选条件为BBB=0.3,DL=0.18,OB=30%;步骤4中设定的筛选条件为log2FoldChange2且q-value0.05。
6.根据权利要求5所述的网络药理学探索中药罗汉果治疗胶质母细胞瘤的作用机制的方法,其特征在于,S2包括如下步骤:
步骤A、罗汉果靶标基因功能分析;
将所述步骤4中筛选出的罗汉果靶标DEGs,导入STRING数据库构建蛋白互作网络,使用GO富集分析、KEGG富集分析和GSEA富集分析,进一步挖掘罗汉果靶标基因与胶质母细胞瘤的相关性;
步骤B、基于靶标识别和通路分析,建立一个化合物—靶标—KEGG通路网络,其节点映射化合物,目标或途径以及指示的相互作用。
7.根据权利要求6所述的网络药理学探索中药罗汉果治疗胶质母细胞瘤的作用机制的方法,其特征在于,其中步骤A中GO富集分析的富集水平设置为q-value=0.001,KEGG富集分析的富集水平设置为q-value=0.001。
8.根据权利要求7所述的网络药理学探索中药罗汉果治疗胶质母细胞瘤的作用机制的方法,其特征在于,S3包括如下步骤:
步骤a、进行分子对接模拟以研究罗汉果中化合物是否可以分别直接结合罗汉果靶标DEGs,推测罗汉果治疗胶质母细胞瘤的潜在分子机制;
步骤b、共表达基因的功能富集分析;
根据Oncomine和GEPIA2数据库,获取罗汉果中化合物与罗汉果靶标DEGs共表达的交集基因,通过ytoHubba筛选出hub基因,使用ClueGO进行通路途径功能富集分析,取KEGG、Wikipathway和Reactome通路交集,将筛选出的hub基因集中富集在补体系统中。
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