[发明专利]用于高效基因组编辑的腺相关病毒载体变异体和其方法

权利要求书

1.一种复制缺陷型腺相关病毒(AAV)在制备用于在不共转导或共投予外源性核酸酶或编码外源性核酸酶的核苷酸的情况下编辑细胞中基因组的目标基因座的药物中的用途，其中所述AAV包含：

a)AAV衣壳，其包含：

(i)一种衣壳蛋白，其包含与SEQ ID NO:2、3、4、6、7、10、11、12、13、14、15、16或17中任一个的氨基酸203至736具有至少90％序列一致性的氨基酸序列；

(ii)一种衣壳蛋白，其包含与SEQ ID NO:2、3、4、5、6、7、9、10、11、12、13、14、15、16或17中任一个的氨基酸138至736具有至少90％序列一致性的氨基酸序列；和/或

(iii)一种衣壳蛋白，其包含与SEQ ID NO:2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16或17中任一个的氨基酸1至736具有至少90％序列一致性的氨基酸序列；和

b)校正基因组，其包含(i)编辑元件，所述编辑元件包含用于整合到细胞染色体的目标基因座中的核苷酸间键或核苷酸序列，(ii)位于所述编辑元件5'端的5'同源臂核苷酸序列，所述核苷酸序列与所述染色体中相对于所述目标基因座的5'区具有同源性，以及(iii)位于所述编辑元件3'端的3'同源臂核苷酸序列，所述核苷酸序列与所述染色体中相对于所述目标基因座的3'区具有同源性。

2.根据权利要求1所述的用途，其中：

(a)所述衣壳蛋白包含与SEQ ID NO:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16或17的氨基酸203-736的氨基酸序列具有至少90％序列一致性的氨基酸序列，其中：所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO：2的氨基酸206对应的氨基酸为C；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸296对应的氨基酸为H；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸312对应的氨基酸为Q；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸346对应的氨基酸为A；所述衣壳蛋白中与SEQ IDNO:2的氨基酸464对应的氨基酸为N；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸468对应的氨基酸为S；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸501对应的氨基酸为I；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸505对应的氨基酸为R；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸590对应的氨基酸为R；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸626对应的氨基酸为G或Y；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸681对应的氨基酸为M；所述衣壳蛋白中与SEQ IDNO:2的氨基酸687对应的氨基酸为R；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸690对应的氨基酸为K；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸706对应的氨基酸为C；或者，所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸718对应的氨基酸为G，

(b)所述衣壳蛋白包含与SEQ ID NO:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16或17的氨基酸138-736的氨基酸序列具有至少90％序列一致性的氨基酸序列，其中：所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO：2的氨基酸151对应的氨基酸为R；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸160对应的氨基酸为D；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸206对应的氨基酸为C；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸296对应的氨基酸为H；所述衣壳蛋白中与SEQ IDNO:2的氨基酸312对应的氨基酸为Q；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸346对应的氨基酸为A；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸464对应的氨基酸为N；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸468对应的氨基酸为S；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸501对应的氨基酸为I；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸505对应的氨基酸为R；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸590对应的氨基酸为R；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸626对应的氨基酸为G或Y；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸681对应的氨基酸为M；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸687对应的氨基酸为R；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸690对应的氨基酸为K；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸706对应的氨基酸为C；或者，所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸718对应的氨基酸为G，和/或

(c)所述衣壳蛋白包含与SEQ ID NO:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16或17的氨基酸1-736的氨基酸序列具有至少90％序列一致性的氨基酸序列，其中：所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO：2的氨基酸2对应的氨基酸为T；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸65对应的氨基酸为I；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸68对应的氨基酸为V；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸77对应的氨基酸为R；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸119对应的氨基酸为L；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸151对应的氨基酸为R；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸160对应的氨基酸为D；所述衣壳蛋白中与SEQ IDNO:2的氨基酸206对应的氨基酸为C；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸296对应的氨基酸为H；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸312对应的氨基酸为Q；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸346对应的氨基酸为A；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸464对应的氨基酸为N；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸468对应的氨基酸为S；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸501对应的氨基酸为I；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸505对应的氨基酸为R；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸590对应的氨基酸为R；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸626对应的氨基酸为G或Y；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸681对应的氨基酸为M；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸687对应的氨基酸为R；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸690对应的氨基酸为K；所述衣壳蛋白中与SEQ ID NO:2的氨基酸706对应的氨基酸为C；或者，所述衣壳蛋白中与SEQ IDNO:2的氨基酸718对应的氨基酸为G。