[发明专利]一种鉴别火把花根与其混伪品的引物及方法在审

专利信息
申请号: 202111244598.5 申请日: 2021-10-26
公开(公告)号: CN113862390A 公开(公告)日: 2021-12-31
发明(设计)人: 王江瑞;蔡蓓蕾;王学政;赵建权;欧洪 申请(专利权)人: 重庆市药研院制药有限公司
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/686;C12Q1/6806;C12N15/11;C12N15/10
代理公司: 重庆市嘉允启行专利代理事务所(普通合伙) 50243 代理人: 胡柯
地址: 400800 重庆市*** 国省代码: 重庆;50
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 一种 鉴别 火把 与其 伪品 引物 方法
【权利要求书】:

1.一种鉴别火把花根与其混伪品的引物,其特征在于,包括有引物对ITS2F和ITS3R,其中正向引物ITS2F的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,反向引物ITS3R的核苷酸序列如SEQID No.2所示。

2.一种根据权利要求1所述的引物对鉴别火把花根与其混伪品的方法,其特征在于,具体步骤如下:

1)分别提取火把花根与其混伪品的基因组DNA;

2)分别以步骤1)中提取的取火把花根与其混伪品的基因组DNA为扩增模板,以引物对ITS2F和ITS3R作为引物,进行PCR扩增,分别得到取火把花根与其混伪品的扩增产物;

3)分别将步骤2)中的各扩增产物利用3%琼脂糖凝胶进行电泳检测其DNA纯度,并将扩增好的DNA进行双向测序;

4)分别将步骤3)中所得的各测序峰图利用CodonCode Aligner V 6.0.2软件进行校对拼接,除去引物区,然后基于隐马尔夫模型的HMMer注释方法将所有测得的序列用CodonCode Aligner V 6.0.2除去两端的5.8S和28S区,从而分别获得火把花根与其混伪品的内部转录间隔区ITS2序列;

5)分别将火把花根与其混伪品的ITS2序列与在GenBank上下载的序列,通过MEGA6.0软件进行序列的比对分析,并计算K2P种间遗传距离建立NJtree,同时利用bootstrap重复检验各分支的支持率,使用PseudoViewer2.5,结合ITS2序列分别绘测出火把花根与其混伪品的ITS2二级结构,通过对比火把花根与其混伪品的ITS2二级结构快速准确地鉴别出火把花根与其混伪品。

3.根据权利要求2所述的引物对鉴别火把花根与其混伪品的方法,其特征在于,所述引物对ITS2F和ITS3R中ITS2F为正向引物,其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,ITS3R为反向引物,核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。

4.根据权利要求2所述的引物对鉴别火把花根与其混伪品的方法,其特征在于,所述火把花根的混伪品包括有雷公藤、东北雷公藤、苦皮藤、南蛇藤、金樱根中的一种或多种。

5.根据权利要求4所述的引物对鉴别火把花根与其混伪品的方法,其特征在于,所述火把花根的ITS2核苷酸序列如SEQ ID No.3所示,所述雷公藤的ITS2核苷酸序列如SEQ IDNo.4所示,所述东北雷公藤的ITS2核苷酸序列如SEQ ID No.5所示,所述苦皮藤的ITS2核苷酸序列如SEQ ID No.6所示,所述南蛇藤的ITS2核苷酸序列如SEQ ID No.7所示,所述金樱根的ITS2核苷酸序列如SEQ ID No.8所示。

6.根据权利要求2所述的引物对鉴别火把花根与其混伪品的方法,其特征在于,步骤1)中所述提取火把花根与其混伪品的基因组DNA提取方法为:采用75%乙醇分别擦洗火把花根与其混伪品的表面,并将其分别粉碎成细分,分别取火把花根与其混伪品各60mg,分别加入液氮后,用全自动快速球磨仪研磨5min,30次/s,分别得到火把花根与其混伪品的样品;

利用优化后的植物DNA提取试剂盒,分别对火把花根与其混伪品的样品按照试剂盒说明操作提取样品总DNA,即得分别提取的火把花根与其混伪品样品的DNA模板。

7.根据权利要求6所述的引物对鉴别火把花根与其混伪品的方法,其特征在于,所述优化后的植物DNA提取试剂盒包括有以下试剂:氯仿、缓冲液GP1、冷冻异丙醇、吸附柱CB3、缓冲液GD、漂洗液PW。

8.根据权利要求2所述的引物对鉴别火把花根与其混伪品的方法,其特征在于,步骤2)中所述PCR扩增反应程序为:94℃预变性5min;94℃变性30s,退火最佳温度为56℃,30s;72℃延伸2min,40个循环;72℃延伸10min。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于重庆市药研院制药有限公司,未经重庆市药研院制药有限公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202111244598.5/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top