[发明专利]一种磨玻璃肺结节分割方法及装置有效
申请号: | 202111308131.2 | 申请日: | 2021-11-05 |
公开(公告)号: | CN114037709B | 公开(公告)日: | 2023-06-16 |
发明(设计)人: | 龚敬;顾雅佳;童彤;彭卫军;汤伟;李海明 | 申请(专利权)人: | 复旦大学附属肿瘤医院 |
主分类号: | G06T7/10 | 分类号: | G06T7/10;G06N3/0464;G06N3/08 |
代理公司: | 上海容慧专利代理事务所(普通合伙) 31287 | 代理人: | 于晓菁 |
地址: | 200032 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 玻璃 结节 分割 方法 装置 | ||
1.一种磨玻璃肺结节分割方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
对肺部CT图像进行预处理;
运用注意力级联残差U-Net模型对肺结节区域实施初分割,得到初分割结果;
使用条件随机场优化所述初分割结果,获得最终分割结果;
输出所述最终分割结果;对CT影像预处理步骤包括:
输入肺部CT序列断层影像ICT;
将所述影像ICT的灰度范围归一化至[-1,1];
选取磨玻璃肺结节中心点,根据肺结节的中心点坐标,剪切出包含磨玻璃肺结节的三维感兴趣区域ROIGGN;
对训练集中样本数据进行增强和扩充;所述注意力级联残差U-Net模型构建步骤包括:
根据卷积神经网络结构,构建包含编码模块和解码模块的注意力级联残差U-Net模型,对所述注意力级联残差U-Net进行训练,得到磨玻璃肺结节分割模型;所述对所述注意力级联残差U-Net进行训练,包括:
构建损失函数,利用所述损失函数对所述模型进行训练;其中,
平衡交叉损失函数BCELoss的计算公式如下:
Dice系数损失函数计算公式如下:
平衡交叉损失函数和Dice系数联合损失函数BCE-DICELoss计算公式如下:
BCE-DICELoss=α*BCELoss+β*DiceLoss
其中,其中,x表示网络的输出预测值,y表示每个像素的真实标签,w为权重系数;α和β分别表示对平衡交叉熵损失和Dice系数损失的加权系数,ε为平滑系数;所述使用条件随机场优化所述初分割结果,包括:
利用能量函数对初分割结果进行优化,所述能量函数计算公式如下:
其中,C表示每个体素的标签;Φu(ci)为一元势函数,表示注意力级联残差U-Net模型输出的体素预测概率;Ψv(ci,cj)为二元势函数;u,v表示预测的体素标签;μ(ci,cj)表示兼容函数;ci、cj表示体素i、j位置对应的标签;fi、fj分别是体素i、j位置任意维度的特征向量;k(fi,fj)是高斯核函数,k(m)表示高斯核,k值设定为2,pi和pj表示两个体素Ii和Ij的位置,θα,θβ和θγ为高斯核的参数。
2.一种磨玻璃肺结节分割装置,其特征在于,所述装置包括:
图像预处理模块,用于调用对肺部CT图像进行预处理;
初始分割模块,运用注意力级联残差U-Net模型对肺结节区域实施初分割,得到初分割结果;
优化模块,用于使用条件随机场优化所述初分割结果,获得最终分割结果;
输出模块,用于输出所述最终分割结果;所述图像预处理模块对CT影像预处理步骤包括:
输入肺部CT序列断层影像ICT;
将所述影像ICT的灰度范围归一化至[-1,1];
选取磨玻璃肺结节中心点,根据肺结节的中心点坐标,剪切出包含磨玻璃肺结节的三维感兴趣区域ROIGGN;
对训练集中样本数据进行增强和扩充;所述初始分割模块对注意力级联残差U-Net模型构建步骤包括:
根据卷积神经网络结构,构建包含编码模块和解码模块的注意力级联残差U-Net模型,对所述注意力级联残差U-Net进行训练,得到肺结节分割模型;所述初始分割模块对所述注意力级联残差U-Net进行训练,包括:
构建损失函数,利用所述损失函数对所述模型进行训练;其中,
平衡交叉损失函数BCELoss的计算公式如下:
Dice系数损失函数计算公式如下:
平衡交叉损失函数和Dice系数联合损失函数BCE-DICELoss计算公式如下:
BCE-DICELoss=α*BCELoss+β*DiceLoss
其中,x表示网络的输出预测值,y表示每个像素的真实标签,w为权重系数;α和β分别表示对平衡交叉熵损失和Dice系数损失的加权系数,ε为平滑系数;所述优化模块使用条件随机场优化所述初分割结果,包括:
利用能量函数对初分割结果进行优化,所述能量函数计算公式如下:
其中,C表示每个体素的标签;Φu(ci)为一元势函数,表示注意力级联残差U-Net模型输出的体素预测概率;Ψv(ci,cj)为二元势函数;u,v表示预测的体素标签;μ(ci,cj)表示兼容函数;ci、cj表示体素i、j位置对应的标签;fi、fj分别是体素i、j位置任意维度的特征向量;k(fi,fj)是高斯核函数,k(m)表示高斯核,k值设定为2,pi和pj表示两个体素Ii和Ij的位置,θα,θβ和θγ为高斯核的参数。
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