[发明专利]一种测序接头及其测序分析系统

权利要求书

1.一种测序接头，其特征在于，呈部分互补配对的Y字形结构，其中一条链从5’至3’依次包括：内部Index序列、Index1测序引物结合区域序列、Index1序列、与芯片探针结合的P7序列；另一条链上从5’至3’依次包括：与芯片探针结合的P5序列、Read1测序引物结合区域序列、内部Index序列和T碱基垂悬。

2.根据权利要求1所述的一种测序接头，其特征在于，在使用时，采用不同长短的内部Index序列接头进行组合完成多样本的标记和测序。

3.根据权利要求2所述的一种测序接头，其特征在于，相邻长短的内部Index序列之间的长度差为一个碱基。

4.根据权利要求2所述的一种测序接头，其特征在于，在使用时，采用两种至四种长度的内部Index序列接头进行组合完成多样本的标记和测序。

5.根据权利要求1所述的一种测序接头，其特征在于，使用的所有内部Index序列在组合后达到内部Index序列在各轮测序循环中的碱基比例基本平衡。

6.根据权利要求5所述的一种测序接头，其特征在于，在一次测序中使用的内部Index数大于等于4个时，内部Index序列在各轮测序循环中的ATCG四种碱基的比例分别各自控制在8% ~ 50%为合适。

7.根据权利要求6所述的一种测序接头，其特征在于，在一次测序中使用的内部Index数大于等于4个时，内部Index序列在各轮测序循环中的ATCG四种碱基的比例分别各自控制在12.5% ~ 37.5%最优。

8.根据权利要求1所述的一种测序接头，其特征在于，使用的所有内部Index序列应满足：(1) 任意两个内部Index序列的最小汉明距离为3；(2) 排除含有三个以上相同连续碱基的Index序列；(3) 内部Index序列的前两个碱基不应该是“GG”。

9.根据权利要求1所述的一种测序接头，其特征在于，在芯片探针结合的P5序列与Read1测序引物结合区域序列之间可以增加Index2序列。

10.一种基于上述测序接头的测序分析系统，其特征在于，包括：

测序监控模块：用于实时监控测序进度并触发分析任务；

数据生成模块：用于将测序生成的BCL文件转换成fastq文件，并过滤低质量序列；同时针对特殊设计的接头使用特异性分析程序将序列数据拆分至对应的样本中；

数据过滤模块：用于去除通过质控的序列中的人源序列；

数据分析模块：用于将非人源序列比对到病原微生物基因组数据库中；

报告生成模块：用于统计分析比对结果，输出分析报告。