[发明专利]用于每簇强度校正和碱基检出的系统和方法

权利要求书

1.一种碱基检出目标簇的计算机实现的方法，所述方法包括：

针对目标簇，

从碱基特异性强度分布中读取针对测序运行的当前测序循环记录的当前通道特异性强度，在所述当前测序循环处将所述目标簇碱基检出到所述碱基特异性强度分布，

从所述碱基特异性强度分布的质心读取当前通道特异性分布强度，

基于所述当前通道特异性强度和所述当前通道特异性分布强度，确定用于所述当前测序循环的一组当前强度校正参数，

通过累加用于所述测序运行的先前测序循环的所述一组当前强度校正参数和一组先前累加强度校正参数，确定用于所述当前测序循环的一组当前累加强度校正参数，

基于所述一组当前累加强度校正参数确定用于所述当前测序循环的当前放大系数和当前通道特异性偏移系数，以及

使用所述当前放大系数和所述当前通道特异性偏移系数来校正针对所述测序运行的下一个测序循环记录的下一个通道特异性强度，并针对所述下一个测序循环生成经过校正的下一个通道特异性强度；以及

基于所述经过校正的下一个通道特异性强度，在所述下一个测序循环处碱基检出所述目标簇。

2.根据权利要求1所述的计算机实现的方法，其中所述一组当前强度校正参数包括当前通道特异性分布强度、当前通道特异性强度误差、当前分布质心到原点的距离和当前分布强度到强度误差相似性度量。

3.根据权利要求1和2中任一项所述的计算机实现的方法，其中所述当前通道特异性强度误差是所述当前通道特异性强度和所述当前通道特异性分布强度之间的逐通道差异。

4.根据权利要求1至3中任一项所述的计算机实现的方法，其中所述当前分布质心到原点的距离是多维空间的所述质心和原点之间的欧几里得距离，所述多维空间包含所述碱基特异性强度分布。

5.根据权利要求1至4中任一项所述的计算机实现的方法，其中所述多维空间是笛卡尔空间、极空间、柱形空间和球形空间中的至少一者。

6.根据权利要求1至5中任一项所述的计算机实现的方法，其中所述当前分布强度到强度误差相似性度量是所述当前通道特异性分布强度和所述当前通道特异性强度误差之间的逐通道点积的总和。

7.根据权利要求1至6中任一项所述的计算机实现的方法，其中所述一组当前累加强度校正参数是所述一组当前强度校正参数中的当前强度校正参数和所述一组先前累加强度校正参数中的先前累加强度校正参数的强度校正逐参数总和。

8.根据权利要求1至7中任一项所述的计算机实现的方法，其中所述一组当前累加强度校正参数是所述当前强度校正参数和所述先前累加强度校正参数的强度校正逐参数平均值。

9.根据权利要求1至8中任一项所述的计算机实现的方法，其中所述一组先前累加强度校正参数和所述一组当前累加强度校正参数以量化的固定位宽格式存储。

10.根据权利要求1至9中任一项所述的计算机实现的方法，其中所述当前通道特异性偏移系数被配置为相同。

11.根据权利要求1至10中任一项所述的计算机实现的方法，其中所述一组当前累加强度校正参数中的当前累加强度校正参数包括用于所述当前通道特异性分布强度的第一公共当前累加强度校正参数，以及用于所述当前通道特异性强度误差的第二公共当前累加强度校正参数。

12.根据权利要求1至11中任一项所述的计算机实现的方法，其中从所述下一个通道特异性强度中逐通道地减去所述当前通道特异性偏移系数，以生成下一个通道特异性移位强度，并且所述下一个通道特异性移位强度除以所述当前放大系数，以生成所述经过校正的下一个通道特异性强度。