[发明专利]一种从蚕蜕或蛹蜕样品中快速提取基因组DNA的试剂盒及方法在审
申请号: | 202210041876.5 | 申请日: | 2022-01-14 |
公开(公告)号: | CN114196670A | 公开(公告)日: | 2022-03-18 |
发明(设计)人: | 李刚;钱荷英;徐安英;赵国栋;郭会朵 | 申请(专利权)人: | 江苏科技大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/6806;C12Q1/686;C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 南京正联知识产权代理有限公司 32243 | 代理人: | 卢霞 |
地址: | 212008*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 样品 快速 提取 基因组 dna 试剂盒 方法 | ||
1.一种从蚕蜕或蛹蜕样品中快速提取基因组DNA的试剂盒,其特征在于,主要由下述3种缓冲液组成:
1)BufferA,组分为:100mmol/L Tris-HCL,pH 7.5;100mmol/L EDTA;100mmol/L NaCl;0.5%SDS;所述BufferA的pH值为7.5,溶剂为蒸馏水;
2)BufferB,5mol/L KAC与6mol/L LiCl进行1:2.5的体积比进行配置而成;
3)BufferC,为无水乙醇,使用前加入25ml ddH2O混匀,预冷使用。
2.采用如权利要求1所述的试剂盒从蚕蜕或蛹蜕中快速提取基因组DNA的方法,其特征在于,包括如下步骤:
1)取蚕蜕或蛹蜕放于研钵中,液氮充分研磨,然后加入BufferA研磨至细粉末状;
2)将粉末小心转移至离心管中,65℃水浴2小时,期间取出上下混匀2次;
3)加BufferB上下轻轻混匀,置冰上10min;
4)4℃12000rpm离心15min;
5)小心吸取上清液于新的离心管中,操作过程中避免吸取底部沉淀;
6)加入预冷异丙醇,轻轻混匀,放置15min,可见白色絮状沉淀产生;
7)弃上清,加入BufferC清洗2次,自然干燥;
8)加入TE buffer或ddH2O,充分溶解DNA,-20℃保存备用。
3.使用SSR标记技术对如权利要求2所述方法抽提得到的基因组DNA进行扩增的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)SSR引物选择:选取SSR引物S1215
Forward-GCACTTTATCTCCTCAGCTACCG
Reverse-TTGGAATAGAGTGGCACGGTTT
(2)PCR扩增
所用PCR仪为Flexigene,Techne
当PCR反应体系为20μl,所用PCR反应试剂及用量分别如下:
为了增加PCR的特异性,实验采用Touch Down PCR(TD-PCR)程序:
94℃变性:5min
第1个循环:94℃30sec,63℃1min,72℃1min;
第2个循环:94℃30sec,62.5℃1min,72℃1min;
第3个循环:94℃30sec,62℃1min,72℃1min;
……
第15个循环:94℃30sec,56℃1min,72℃1min;
前15个循环退火温度每次降低0.5℃,由63℃降至56℃;后25个循环退火温度采用56℃,即
第16-25个循环:94℃30sec,56℃1min,72℃1min;
72℃延伸:5min;
4℃保温;
PCR反应结束后,取3μl产物在1.5%的琼脂糖凝胶中电泳分离,并以标准浓度的DL2000DNA作为标准,检测PCR产物的扩增效果及浓度。
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