[发明专利]一组用于亲缘关系鉴识的X染色体Multi-DIP的同步分型检测体系

说明书

本发明公开一组用于亲缘关系鉴识的X染色体Multi‑DIP的同步分型检测体系，涉及生物技术领域；该同步分型检测体系，包含17个位于X染色体上的Multi‑DIP分子遗传标记。本发明以Multi‑DIP分子遗传标记为研究对象，系统甄选在国内群体中具有高度遗传多态性的X染色体Multi‑DIP分子遗传标记用于我国群体的疑难、复杂亲缘关系的鉴识研究；采用NGS技术，将甄选的Multi‑DIP分子遗传标记研发成一个同步并行检测体系，用于我国群体疑难、复杂亲缘关系鉴识的应用研究。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，特别是涉及一组用于亲缘关系鉴识的X染色体Multi-DIP的同步分型检测体系。

背景技术

亲权鉴定是指应用医学、分子生物学、遗传学以及其他学科的理论和技术来判断待鉴定的个体之间是否存在某种生物学亲缘关系。近年来涉及疑难、复杂案件的亲缘关系鉴定是长期困扰法医工作者的难题。既往检测的遗传标记较少、多态性较低，这导致体系的系统效能不足。此外，遗传标记发生突变，往往是造成许多亲缘关系鉴定形成疑难案件的原因。全同胞、半同胞、旁系及隔代等复杂亲缘关系鉴定也是法医工作者经常面临的棘手问题。性染色体遗传标记，如位于X染色体上的遗传标记，表现为伴性遗传的模式，即父亲的X染色体只能传递给其女性后代，这种遗传模式使X染色体遗传标记在疑难、复杂亲缘关系(隔代的祖孙、姑侄女和姨外甥等)鉴识中拥有独特的应用价值。因此，X染色体上高度多态性分子遗传标记的甄选，对于疑难、复杂亲缘关系的鉴识研究具有重要意义。

目前，法医学家通常采用X染色体短串联重复序列(short tandem repeat，STR)用于复杂亲缘关系的鉴识研究，但是STR在实际应用中存在以下问题：1)STR的突变率比较高，约为8.4×10^-4，这可能导致鉴定结果的误判。2)STR在PCR过程中存在stutter等伪峰，这对分型结果会产生干扰。3)常用的STR扩增子比较大，不利于陈旧降解检材的分析检测。4)性染色体STR研究较少，特别是可以复合扩增的性染色体STR基因座更少，这不利于复杂亲缘关系的鉴定。因此，甄选具有更高效能和更低突变率的分子遗传标记对于疑难、复杂亲缘关系的鉴识研究具有重要意义。

缺失/插入多态性(deletion/insertion polymorphism，DIP)作为新一代遗传标记，它兼具STR和单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)的优势，近几年在法医学研究中表现出极好的应用前景，国内外学者也研发了多个检测体系用于法医学的亲缘关系鉴识研究。然而，目前法医学中常用的DIP多为二等位基因变异，它们相比STR具有较低的多态性，往往需要更多的位点才能达到目前常用的STR遗传标记的法医学应用效能。对此，我国学者提出一种新型分子遗传标记，Multi-DIP，其类似于微单倍型，由一段DNA区域内的多个DIP位点构成；相比单一的DIP位点，Multi-DIP可表现出更多的等位基因变异，具有更高的多态性，可在法医学亲缘关系鉴识研究中提供更高的价值。

新一代测序(next generation sequencing，NGS)作为近几年新兴的检测技术，相比毛细管电泳平台，其不受可标记的荧光物质的限制，可用于多个遗传标记的分型检测。更为重要的是，NGS可以检测遗传标记中存在的序列变异，这可进一步提高遗传标记的遗传多态性，使其表现出更好的法医学应用效能。因此，可基于NGS平台研发用于法医学应用研究的各种遗传标记的分型检测体系。

发明内容

本发明的目的是提供一组用于亲缘关系鉴识的X染色体Multi-DIP的同步分型检测体系，以解决上述现有技术存在的问题，本发明以Multi-DIP分子遗传标记为研究对象，系统甄选在国内群体中具有高度遗传多态性的X染色体Multi-DIP分子遗传标记用于我国群体的疑难、复杂亲缘关系的鉴识研究；采用NGS技术，将甄选的Multi-DIP分子遗传标记研发成一个同步并行检测体系，用于我国群体的亲缘关系鉴识。

为实现上述目的，本发明提供了如下方案：