[发明专利]一种检测BRAF基因突变的引物探针组合物、试剂盒及其使用方法和应用在审
申请号: | 202210426209.9 | 申请日: | 2022-04-21 |
公开(公告)号: | CN114634987A | 公开(公告)日: | 2022-06-17 |
发明(设计)人: | 邓微;兰玲;苟默;周美岑;魏星 | 申请(专利权)人: | 北京积水潭医院;北京华诺奥美基因生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 成都顶峰专利事务所(普通合伙) 51224 | 代理人: | 钱学宇 |
地址: | 100000 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 braf 基因突变 引物 探针 组合 试剂盒 及其 使用方法 应用 | ||
1.一种检测BRAF基因突变的引物探针组合物,其特征在于,所述引物探针组合物包括检测BRAF基因突变位点c.1919A>C的实时荧光PCR引物和检测探针;
所述实时荧光PCR引物包括SEQ ID No.1~2所示的氨基酸序列;
所述检测探针包括SEQ ID No.3所示的氨基酸序列。
2.根据权利要求1所述检测BRAF基因突变的引物探针组合物,其特征在于,所述探针为Taqman探针,所述Taqman探针的5’端标记有荧光报告基团,3’端标记有荧光淬灭基团;
所述荧光报告基团包括FAM、Cy5、ROX、VIC和NED中的任一种;所述荧光淬灭基团包括MGB、NFQ、QSY、MGB和BHQ1中的任一种。
3.根据权利要求2所述检测BRAF基因突变的引物探针组合物,其特征在于,所述荧光报告基团为VIC;所述荧光淬灭基团为MGB。
4.一种检测BRAF基因突变的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1~3任一项所述的引物探针组合物。
5.根据权利要求4所述的检测BRAF基因突变的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括针对人类CFTR基因保守序列特异性的内参引物和内参探针;
所述内参引物包括SEQ ID No.4~5所示的的核苷酸序列;所述内参探针包括SEQ IDNo.6所示的的核苷酸序列。
6.根据权利要求5所述的检测BRAF基因突变的试剂盒,其特征在于,所述内参探针的5’端标记有荧光报告基团,3’端标记有荧光淬灭基团;
所述内参探针的荧光报告基团与所述检测探针的荧光报告基团不同;
优选地,所述内参探针的荧光报告基团为NED,所述内参探针的荧光淬灭基团为MGB。
7.一种根据权利要求4~6任一项所述的试剂盒以非疾病诊断和/或治疗为目的的使用方法,其特征在于,其包括:
提取待测样本的基因组,使用所述试剂盒对所述待测样本的基因组进行扩增,检测荧光信号,将荧光信号的阈值限设置为0.15,分析Ct值。
8.根据权利要求7所述的使用方法,其特征在于,所述扩增的程序包括:
预变性:95℃、30sec,1个循环;
循环扩增:95℃、10sec,60℃、30sec;
所述循环扩增的次数为45次。
9.一种根据权利要求4~6任一项所述的试剂盒在制备BRAF基因突变相关的癌症诊断试剂中的应用。
10.根据权利要求9所述的应用,其特征在于,所述癌症包括甲状腺乳头状癌、结直肠癌和黑色素瘤。
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