[发明专利]一种用于预测母猪二胎综合征的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明涉及一种用于预测母猪“二胎综合征”的SNP分子标记及其应用，属于分子标记检测技术领域。本发明首次发现猪第12号染色体上第43594186bp位点的SNP分子标记与母猪“二胎综合征”发生相关，基因型为AA时，母猪“二胎综合征”发生率较高；基因型为AC或CC时，母猪“二胎综合征”发生率较低。利用本发明所述SNP分子标记，不仅可以在种猪早期快速预测“二胎综合征”的发生情况，同时还可用于低“二胎综合征”发生率种猪的选育。本发明对于无“二胎综合征”母猪选育具有重要的意义。

技术领域

本发明涉及一种用于预测母猪“二胎综合征”的SNP分子标记及其应用，属于分子标记检测技术领域。

背景技术

初产母猪较易出现难产、产程长、产后易感染、乳房发育不良，二胎窝产仔数少、断奶后反复发情、奶水不足等等现象，称为“二胎综合征”。管理水平较高的规模化猪场母猪“二胎综合征”发生率较低，约为10％左右，而饲养管理水平相对较差的小养殖场户，二胎综合征发生率可达30％，甚至更高。二胎综合征的出现严重影响母猪繁殖成绩，并造成二胎母猪较高的淘汰率，给猪场带来较大的经济损失。

有关母猪二胎综合征产生的原因，国内外研究者已做了大量探讨，普遍认为二胎综合征的发生率与饲养管理如配种日龄、营养水平和哺乳时间等等因素有关。但即使在管理水平较高的大型规模养殖场，仍有10％左右的母猪会发生“二胎综合征”。有报道指出，一些母猪生长发育缓慢，特别是骨架、骨盆和产道发育状态对二胎综合征影响较大。因此本研究团队推测，尽管母猪“二胎综合征”的发生率与上述饲养管理水平的高低有关，但“二胎综合征”也可能与某些基因的表达有关，并首次提出科学的饲养管理虽然能够降低母猪二胎综合征的发生率，但并不能彻底解决母猪二胎综合征问题，如果将分子标记，特别是将基因组选育(GS)技术应用于二胎综合征母猪的研究，筛选出母猪二胎综合征相关的SNP 分子标记，必将大大提高无二胎综合征母猪选育的精确性，再辅以科学规范的饲养管理，有望从根本上解决母猪二胎综合征问题。

目前GWAS已广泛应用于候选基因筛选相关研究，如杜洛克母猪初情期日龄的相关研究、猪腹股沟/阴囊疝易感基因的筛选、杜洛克猪生长性状研究以及不同种猪瘦肉量全基因组关联分析等等。

但到目前为止，在国内外还未见利用GWAS技术探讨猪“二胎综合征”相关分子标记的研究。

发明内容

本发明主要目的在于提供一种用于预测母猪“二胎综合征”的SNP分子标记及其应用。本发明首次发现位于猪第12号染色体上第43594186bp位点的SNP分子标记与母猪“二胎综合征”发生相关，通过检测SNP位点突变信息可以预测母猪二胎综合征发生概率，并用于种猪无“二胎综合征”分子标记辅助育种工作。

为实现上述目的，本发明采用以下技术方案：

本发明第一方面提供一种用于预测母猪“二胎综合征”的SNP分子标记，所述SNP分子标记位于猪参考基因组10.2版本的第12号染色体上第43594186bp位点，该位点存在 A/C碱基突变。

本发明第二方面提供以上第一方面所述SNP分子标记在预测母猪“二胎综合征”和/或选育低“二胎综合征”发生率的种猪中的应用。

本发明第三方面，提供一种用于检测第一方面所述SNP分子标记的引物组合，其上游引物序列为：ACCCAAACAGAGGCAACACAG；

下游引物序列为：TTTAGCACCACCAGAGTTTGAGG。

本发明第四方面，提供一种用于预测母猪“二胎综合征”的试剂盒，所述试剂盒包括以上第三方面所述的引物组合。

本发明第五方面，提供第三方面所述引物组合或第四方面所述试剂盒在预测母猪“二胎综合征”和/或选育低“二胎综合征”发生率的种猪中的应用。

与现有技术相比，本发明具有以下优势：