[发明专利]一种毛霉菌特异性PCR检测引物组及其应用在审
申请号: | 202210803530.4 | 申请日: | 2022-07-07 |
公开(公告)号: | CN115838819A | 公开(公告)日: | 2023-03-24 |
发明(设计)人: | 刘维达;梁官钊;张美洁;梅嬛 | 申请(专利权)人: | 中国医学科学院皮肤病医院(中国医学科学院皮肤病研究所) |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11;C12Q1/6883;C12Q1/686;C12R1/785 |
代理公司: | 苏州铭浩知识产权代理事务所(普通合伙) 32246 | 代理人: | 于浩江 |
地址: | 210000 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 毛霉 特异性 pcr 检测 引物 及其 应用 | ||
1.一种毛霉菌特异性PCR检测引物组,其特征在于:
基于毛霉目真菌特异性片段hmgR3的基因序列设计一对PCR扩增引物组:
上游引物5’-TTGATCGGCTCTGCTATG-3’;
下游引物5’-ATGAGGACCACGAACACC-3’;
通过PCR扩增可在毛霉目真菌菌种中得到特异性的270bp条带。
2.如权利要求1所述的毛霉菌特异性PCR检测引物组的应用,其特征在于:应用在毛霉病患者的临床检测中。
3.根据权利要求2所述的毛霉菌特异性PCR检测引物组的应用,其特征在于,包含以下步骤:
①提取丝状真菌样本DNA;
②以步骤①中提取的DNA为模板,对PCR扩增引物组进行PCR;
③对PCR扩增产物进行检测。
4.根据权利要求3所述的毛霉菌特异性PCR检测引物组的应用,其特征在于:所述步骤①中丝状真菌碾磨破壁后,采用试剂盒(OMEGA FUNGAL DNA KIT1000)对样本基因组DNA进行提取。
5.根据权利要求3所述的毛霉菌特异性PCR检测引物组的应用,其特征在于:所述步骤②中PCR采用TransStart Fastpfu DNA Polymerase,20μl反应体系:其中5×FastPfuBuffer 4μl,2.5mM dNTPs 2μl,5μM上游引物0.8μl,5μM下游引物0.8μl,FastPfuPolymerase 0.4μl,DNA模板10ng,ddH2O补至20μl。
6.根据权利要求3所述的毛霉菌特异性PCR检测引物组的应用,其特征在于:所述步骤②中PCR扩增程序为:95℃预变性5min,95°C变性30s,55℃退火20s,72℃延伸45s,共35个循环,72℃
延伸10min。
7.根据权利要求3-6中任一项权利要求所述的毛霉菌特异性PCR检测引物组的应用,其特征在于:所述步骤③中检测步骤为:用2%琼脂糖凝胶电泳检测纯化后PCR扩增产物。
8.根据权利要求3所述的毛霉菌特异性PCR检测引物组的应用,其特征在于:所述步骤③中PCR能扩增出270bp的特异性条带,则说明检测样本存在毛霉菌感染,检测组织来源存在毛霉病情况。
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