[发明专利]鉴定气单胞菌的特异性新分子靶标及其快速检测方法有效

专利信息
申请号: 202211192206.X 申请日: 2022-09-28
公开(公告)号: CN115976237B 公开(公告)日: 2023-08-22
发明(设计)人: 李滢;张友雄;吴清平;谢新强;张菊梅;丁郁;王涓;薛亮;陈谋通;叶青华;吴诗;庞锐;古其会 申请(专利权)人: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心);广东环凯生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/686;C12N15/11;C12R1/01
代理公司: 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 代理人: 刘明星
地址: 510000 广东省*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 鉴定 气单胞菌 特异性 分子 靶标 及其 快速 检测 方法
【权利要求书】:

1.一组用于检测气单胞菌属及嗜水气单胞菌、维氏气单胞菌、豚鼠气单胞菌的分子靶标,其特征在于,所述的气单胞菌属(Aeromonas)的分子靶标核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)的分子靶标核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,维氏气单胞菌(Aeromonas veronii)的分子靶标核苷酸序列如SEQ.ID No.3所示,豚鼠气单胞菌(Aeromonas caviae)的分子靶标核苷酸序列如SEQ.ID No.4所示。

2.一组用于检测气单胞菌属及嗜水气单胞菌、维氏气单胞菌、豚鼠气单胞菌的引物组,其特征在于,所述的引物组包括:检测气单胞菌的引物包括SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示的引物;检测嗜水气单胞菌的引物包括SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示的引物;检测维氏气单胞菌的引物包括SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.10所示的引物;检测豚鼠气单胞菌的引物包括SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.12所示的引物。

3.一种非疾病的诊断和治疗目的的检测气单胞菌属及嗜水气单胞菌、维氏气单胞菌、豚鼠气单胞菌的方法,其特征在于,提取样品的DNA,然后用权利要求2所述的用于检测气单胞菌属及嗜水气单胞菌、维氏气单胞菌、豚鼠气单胞菌的引物组分别进行PCR扩增,如获得条带大小为127bp,则含有气单胞菌;如获得条带大小为386bp,则含有嗜水气单胞菌;如获得条带大小为333bp,则含有维氏气单胞菌;如获得条带大小为259bp,则含有豚鼠气单胞菌。

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述的PCR,其反应体系为2×PrimeSTARMax Premix 12.5μL,正向引物10μmol/L 1μL,反向引物10μmol/L 1μL,模板DNA 2.5ng/μL1μL,ddH2O 9.5μL。

5.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述PCR,其反应程序为98℃预变性3min;98℃变性10s、60℃退火5s、72℃延伸5s,共进行35个循环;72℃延伸10min。

6.一种非疾病的诊断和治疗目的的对气单胞菌属及嗜水气单胞菌、维氏气单胞菌、豚鼠气单胞菌进行定量的qPCR检测方法,其特征在于,包括如下步骤:

(1)应用权利要求2所述的用于检测气单胞菌属及嗜水气单胞菌、维氏气单胞菌、豚鼠气单胞菌的引物组分别绘制气单胞菌属及嗜水气单胞菌、维氏气单胞菌、豚鼠气单胞菌的标准曲线;

(2)应用权利要求2所述的用于检测气单胞菌属及嗜水气单胞菌、维氏气单胞菌、豚鼠气单胞菌的引物组对样本进行qPCR扩增,获得样本的ct值,根据标准曲线计算该样本中含气单胞菌属、嗜水气单胞菌、维氏气单胞菌或豚鼠气单胞菌的含量。

7.根据权利要求6所述的qPCR检测方法,其特征在于,所述的qPCR,其扩增体系为:2×SYBR Green Premix 反应液5 μL,待测模板DNA 1uL,10 μmol/L引物各0.5 μL,灭菌双蒸水3μL。

8.根据权利要求6所述的qPCR检测方法,其特征在于,所述的qPCR,其反应程序两步法PCR反应程序:95℃预热30s;两步法扩增95℃ 5s、60℃退火30s,共进行40个循环。

9.一种检测气单胞菌属及嗜水气单胞菌、维氏气单胞菌、豚鼠气单胞菌的试剂盒,其特征在于,包括权利要求2所述的用于检测气单胞菌属及嗜水气单胞菌、维氏气单胞菌、豚鼠气单胞菌的引物组。

10.权利要求1所述的用于检测气单胞菌属及嗜水气单胞菌、维氏气单胞菌、豚鼠气单胞菌的分子靶标、权利要求2所述的用于检测气单胞菌属及嗜水气单胞菌、维氏气单胞菌、豚鼠气单胞菌的引物组在检测气单胞菌属及嗜水气单胞菌、维氏气单胞菌、豚鼠气单胞菌中的应用,该应用是非疾病的诊断和治疗目的的。

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