[发明专利]用于检测靶RNA的方法和组合物在审
| 申请号： | 202211656487.X | 申请日： | 2017-06-13 |
| 公开（公告）号： | CN116287127A | 公开（公告）日： | 2023-06-23 |
| 发明（设计）人： | J·A·多德纳;M·R·奥康奈尔;A·伊斯特-塞莱茨基;S·C·奈特;J·H·多德纳凯特 | 申请（专利权）人： | 加利福尼亚大学董事会 |
| 主分类号： | C12Q1/6816 | 分类号： | C12Q1/6816 |
| 代理公司： | 中国贸促会专利商标事务所有限公司 11038 | 代理人： | 陈晓娜 |
| 地址： | 美国加*** | 国省代码： | 暂无信息 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 用于 检测 rna 方法 组合 | ||
1.一种检测包含多种RNA的样品中的单链靶RNA的方法，所述方法包括：
a)使所述样品与以下接触：
(i)C2c2指导RNA，其与所述单链靶RNA杂交；和
(ii)C2c2蛋白，其切割所述样品中存在的RNA；以及
b)测量由C2c2蛋白介导的RNA切割产生的可检测信号。
2.一种检测包含多种RNA的样品中的单链靶RNA的方法，所述方法包括：
(a)使所述样品与以下接触：
(i)前体C2c2指导RNA阵列，其包含两个或更多个C2c2指导RNA，每个所述C2c2指导RNA具有不同的指导序列；和
(ii)C2c2蛋白，其将所述前体C2c2指导RNA阵列切割成单独的C2c2指导RNA，并且还切割所述样品的RNA；以及
(b)测量由C2c2蛋白介导的RNA切割产生的可检测信号。
3.根据权利要求1或权利要求2所述的方法，其中所述C2c2蛋白在所述接触1小时内切割所述样品中存在的所述RNA的至少50％。
4.根据权利要求3所述的方法，其中所述C2c2蛋白在所述接触40分钟内切割所述样品中存在的所述RNA的至少50％。
5.根据权利要求4所述的方法，其中所述C2c2蛋白在所述接触5分钟内切割所述样品中存在的所述RNA的至少50％。
6.根据权利要求5所述的方法，其中所述C2c2蛋白在所述接触1分钟内切割所述样品中存在的所述RNA的至少50％。
7.根据权利要求1所述的方法，其中所述C2c2蛋白在所述接触1分钟内切割所述样品中存在的所述RNA的50％至多于90％。
8.根据权利要求1-7中任一项所述的方法，其中可以检测到所述单链靶RNA的最小浓度在500fM至1nM的范围内。
9.根据权利要求1-7中任一项所述的方法，其中可以在低至800fM的浓度下检测到所述单链靶RNA。
10.根据权利要求1-9中任一项所述的方法，其中所述C2c2蛋白不是包含与SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列具有至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少98％、至少99％或100％的氨基酸序列同一性的氨基酸序列的沙氏纤毛菌(Lsh)C2c2蛋白。
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