[发明专利]预测蛋白质间相互作用的方法无效
| 申请号： | 01806363.2 | 申请日： | 2001-03-09 |
| 公开（公告）号： | CN1416549A | 公开（公告）日： | 2003-05-07 |
| 发明（设计）人： | 土居洋文;铃木敦 | 申请（专利权）人： | 第一制药株式会社;富士通株式会社 |
| 主分类号： | G06F17/30 | 分类号： | G06F17/30;C07K7/06;C07K14/435;G01N33/68 |
| 代理公司： | 中国专利代理(香港)有限公司 | 代理人： | 曹雯,孟凡宏 |
| 地址： | 日本东*** | 国省代码： | 暂无信息 |
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| 摘要： | 蛋白质间相互作用的预测方法，其特征是(1)将蛋白质A的氨基酸序列分解成某种长度的寡肽，(2)在蛋白质数据库中检索具有上述寡肽的蛋白质C，或者检索具有与上述寡肽相同的寡肽的蛋白质D，(3)对上述A与检索出的C或D进行局部排列，(4)根据局部排列的结果及蛋白质数据库中氨基酸频率或寡肽的频率计算出的数值为指标，将检索出的C或D预测为与蛋白质A相互作用的蛋白质B；搭载该预测程序的记录介质；搭载该记录介质的预测装置和由他们得到的蛋白质。 | ||
| 搜索关键词： | 预测 蛋白质 相互作用 方法 | ||
【主权项】：
1.蛋白质间相互作用的预测方法，它是预测与特定的蛋白质或多肽(A)相互作用的蛋白质或多肽(B)的方法，其特征在于，(1)将A的氨基酸序列分解成数个某种长度的寡肽作为序列信息；(2)在蛋白质或多肽的氨基酸序列数据库中检索具有上述各寡肽的氨基酸序列的蛋白质或多肽(C)，或者检索具有与上述寡肽的氨基酸序列相同氨基酸序列的蛋白质或多肽(D)；(3)对上述A与栓索出的C或D间氨基酸序列进行局部排列；(4)根据局部排列的结果及蛋白质或多肽的氨基酸序列数据库中氨基酸频率和/或寡肽的频率计算出的数值为指标，将检索出的C和/或D预测为与A相互作用的蛋白质或多肽(B)。
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