[发明专利]基因芯片用人类白细胞抗原分型探针的筛选及其应用方法

摘要

本发明公开了一种人类白细胞抗原高分辨率、并且探针调试以及确定判定阀值容易的分型探针筛选及其应用方法，提出了对多态性位点进行“分组”的解决方案，依此方法设计出来的分型探针，检测位点定位准确并且包容性较强，分辨率高。本发明的全部筛选过程全部由设计的一套计算机软件来执行，所以，可以快速准确地筛选出理想的分型探针。而且本专利还描述了各种匹配关系表的构建方法及如何根据这些匹配关系表一步步由芯片杂交结果判断出待测样品的白细胞抗原类型，解决了该分型探针在实际工作中的应用问题。

主权项

1.一种基因芯片用人类白细胞抗原分型探针的筛选方法，其特征在于：该方法包括如下步骤：A.将人类白细胞抗原各等位基因的序列比对结果由网络中下载到计算机的存储器中，建立一个数据库；B.读取数据库中所有白细胞抗原多态性位点的信息；C.检测所有多态性位点，并将所有多态性位点按碱基位置相互临近的原则分为若干位点组；D.检索同一多态性位点组内出现的所有组合，比较每两种组合，找出碱基类型不相同的碱基位置形成新的数据组；E.根据数据组中每个多态性位点出现的情况确定分型探针的检测位点；F.根据探针的检测位点找出探针的序列。