[发明专利]转基因产品检测寡核苷酸芯片的制作方法及其应用

摘要

本发明公开了一种用于转基因产品检测的寡核苷酸芯片的制造方法及其应用，属于核酸检测技术，具体地说，其是根据已知转基因产品基因组中所含的异源插入基因、物种内标基因、特异性边界序列等设计特异性的寡核苷酸探针及相应引物，然后将探针固定在载玻片上构成转基因产品检测芯片。用相应引物对待检植物的DNA进行扩增并用荧光标记后，使之与芯片杂交，根据杂交信号，获取待检植物是否为转基因产品、是何种转基因产品以及是何品系等多种信息。

主权项

1.一种转基因产品检测寡核苷酸探针阵列，其特征在于，设计15-35聚探针，探针的Tm值(解链温度)基本相同。异源插入基因 探针 长度 TmCaMV35S启动子 TGCTCCACCATGTTGACGAAG<210>1 21 61.6FMV35S启动子 AAAACCAAGAAGGAACTCCCATC<210>4 23 60.7CAMV35终止子 GAAACCCTTAGTATGTATTTGTATTTGTAA<210>7 30 60.0Nos启动子 GACCTTAGGCGACTTTTGAACG<210>10 22 60.9Nos终止子 AATCCTGTTGCCGGTCTTGC<210>13 22 62.3Npt II GCTCCTGCCGAGAAAGTATCC<210>16 21 60.6Bar CTGTGCCTCCAGGGACTTCA<210>19 20 60.5PAT GCCACAACACCCTCAACCTCA<210>22 21 62.8Barnase GTCTGAAGATAATCCGCAACCC<210>25 22 60.4Barstar ACCTGGACGCTTTATGGGATT<210>28 21 60.3EPSPS(大豆) GGAAAGGCCAGAGGATTTGC<210>31 20 61.1EPSPS(油菜) GGGTCTTGTTGGTGTTTACGATT<210>34 23 60.1Cry I A(b) CAGCACGGGGTTGGTGTAGAT<210>37 21 62.1Cry I A(c) TCTGGTAGATGTGGATGGGAAGT<210>40 23 60.1CryIIIA AAGCTGCCAACACCCACTTG<210>43 20 60.8Cry9C CAAGTACACCAACTACTGCGAGACC<210>46 25 62.3GOX GTTCTTCAGAACTGGCAGGAGC<210>49 22 60.7CaMV-CP TATGACAACTACCGACGACTCGA<210>52 23 60.0植物物种 探针 长度 Tm内标基因Lectin TCTATCAGATCCATCAAAACGACG<210>55 24 61.1Zein TTCTGGCTCTAACTTGGTTCCG<210>58 22 61.3Fbp TGCTACTCGTTTCCCGCTCA<210>61 20 61.7Rbc1(相花) GGTGGGCTTGATTTTACCAAAG<210>64 22 60.7Rbc1(马铃薯) TGTCTTCGAGGTGGACTTGATTT<210>67 23 60.5植物特异 探针 长度 Tm边界序列Bt9c AGAGAAATGACCCCGTGTTCTC<210>70 22 60.0Bt176 GGGGTTGTTGTCCATTGTTGG<210>73 21 62.2GA21 GATCCGGTGCATGGCCG<210>76 17 63.2Mon810 GGGCAATGGCAAAGGATGTT<210>79 20 62.1BT11 GACGCTCAGTGGAACGAAAACT<210>82 22 61.0BT25 CTCCGGAGACATGTCGACTCTAG<210>85 23 60.6RRS AAAATAAACATAGGGAACCCAAATG<210>88 25 60.5华蕃一号 GATTACGAATTCCCATGGAGTC<210>91 22 60.0通过点样仪转移到经化学基团修饰的玻片上，经SDS、纯水处理制成。