[发明专利]三维结构活性相关法无效
申请号: | 200380100987.4 | 申请日: | 2003-10-07 |
公开(公告)号: | CN1703704A | 公开(公告)日: | 2005-11-30 |
发明(设计)人: | 小谷孝行;东浦邦彦 | 申请(专利权)人: | 日本臓器制药株式会社 |
主分类号: | G06F17/50 | 分类号: | G06F17/50 |
代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司 | 代理人: | 胡烨 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 日本;JP |
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摘要: | 三维结构活性相关法的组解析包含以下的工序:寻求在虚拟空间内已叠合的多个分子所包含的各原子坐标的工序B1;计算各原子与其它原子的原子间距离,对所计算的原子间距离中的最短的原子间距离及构成该最短的原子间距离的2个原子进行特定的工序B2;所计算的最短原子间距离在规定的阈值以下时,将具有最短原子间距离的2个原子从三维空间删除的同时,在该删除的2个原子的坐标的加权平均坐标上制作代表这2个原子的原子的工序B3;在工序B3之后,返回到工序B2的工序B4;所计算的最短原子间距离超过规定的阈值时,结束工序B的第5工序B5。该方法能够大幅度减少3D QSAR解析所需的计算量和存储空间。 | ||
搜索关键词: | 三维 结构 活性 相关 | ||
【主权项】:
1.三维结构活性相关法,它是以虚拟空间内叠合的多个分子的原子坐标为基础,提取该化合物的特征并视觉化地表示的方法,其特征在于,包括以下工序:在虚拟空间内使多个分子叠合的工序A,对在虚拟空间内已叠合的多个分子的原子坐标进行组解析,制作代表点的工序B,计算已叠合的多个分子的各原子与代表点的相互作用的工序C,统计解析相互作用的工序D;进行组解析的工序B还包含以下的工序:寻求在虚拟空间内已叠合的多个分子所包含的各原子坐标的第1工序B1;计算各原子与其它原子的原子间距离,对所计算的原子间距离中的最短的原子间距离及构成该最短的原子间距离的2个原子进行特定的第2工序B2;所计算的最短原子间距离在规定的阈值以下时,将具有最短原子间距离的2个原子从三维空间删除的同时,在该删除的2个原子的坐标的加权平均坐标上制作代表这2个原子的原子的第3工序B3;在第3工序B3之后,返回到第2工序B2,包含在第3工序制作的原子再进行第2工序的第4工序B4;所计算的最短原子间距离超过规定的阈值时,结束工序B的第5工序B5。
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